# Jmol state version 14.32.64  2022-07-26 16:18;
  # fullName = "jmolApplet0__089538622793089__";
  # documentBase = "file:///Users/emartz/DOSFiles/D-disk/ERICS1WS/jmol/fgij/fg.htm?mol=6mx4-revdat2020-nohet.pdb%26offline%26bu%3D1%26bbonly%3D10";
  # codeBase = "file:///Users/emartz/DOSFiles/D-disk/ERICS1WS/jmol/fgij/jsmol/j2s/";


function _setWindowState() {
# width 837;
# height 677;
  stateVersion = 1432064;
  background [xffffff];
  axis1Color = "[xff0000]";
  axis2Color = "[x008000]";
  axis3Color = "[x0000ff]";
  set ambientPercent 30;
  set diffusePercent 84;
  set specular true;
  set specularPercent 22;
  set specularPower 100;
  set specularExponent 4;
  set celShading false;
  set celShadingPower 10;
  set zShadePower 3;
}

function _setFileState() {

  set allowEmbeddedScripts false;
  set appendNew true;
  set appletProxy "";
  set applySymmetryToBonds false;
  set autoBond true;
  set bondRadiusMilliAngstroms 150;
  set bondTolerance 0.45;
  set defaultLattice {0 0 0};
  set defaultLoadFilter "";
  set defaultLoadScript "";
  set defaultStructureDssp true;
  set defaultVDW Auto;
  set forceAutoBond false;
  #set defaultDirectory "";
  #set loadFormat "https://files.rcsb.org/download/%FILE.pdb";
  #set loadLigandFormat "https://files.rcsb.org/ligands/download/%FILE.cif";
  #set smilesUrlFormat "https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure/%FILE/file?format=sdf&get3d=true";
  #set nihResolverFormat "https://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure";
  #set pubChemFormat "https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/%FILE/SDF?record_type=3d";
  set bondingVersion 0;
  set legacyAutoBonding false;
  set legacyAutoBonding false;
  set legacyHAddition false;
  set legacyJavaFloat false;
  set minBondDistance 0.4;
  set minimizationCriterion  0.001;
  set minimizationSteps  100;
  set multipleBondBananas false;
  set pdbAddHydrogens false;
  set pdbGetHeader false;
  set pdbSequential false;
  set percentVdwAtom 23;
  set smallMoleculeMaxAtoms 40000;
  set smartAromatic true;
  load "/wiki/images/6/6b/6mx4-nohet.pdb.gz" FILTER "*.CA;biomolecule 1;bmchains;/=10";

}

function _setParameterState() {

   set defaultanglelabel "%VALUE %UNITS";
   set defaultcolorscheme "jmol";
   set defaultdistancelabel "%VALUE %UNITS";
   set defaultdrawarrowscale 0.5;
   set defaultlabelpdb "%m%r";
   set defaultlabelxyz "%a";
   set defaultlattice "{0 0 0}";
   set defaultloadfilter "";
   set defaultloadscript "";
   set defaulttorsionlabel "%VALUE %UNITS";
   set defaulttranslucent 0.5;
   set defaultvdw "Auto";
  set allowembeddedscripts true;
  set allowmoveatoms false;
  set allowrotateselected false;
  set animationmode "once";
  set appletproxy "";
  set applysymmetrytobonds false;
  set atomtypes "";
  set autobond true;
  set autofps false;
  set axes window;
  set axesmode 0;
  set axesoffset 0.0;
  set axesscale 2.0;
  set bondmodeor false;
  set bondradiusmilliangstroms 150;
  set bondtolerance 0.45;
  set cartoonbaseedges false;
  set cartoonblockheight 0.5;
  set cartoonblocks false;
  set cartoonfancy false;
  set cartoonladders false;
  set cartoonrockets false;
  set cartoonsteps false;
  set chaincasesensitive false;
  set dataseparator "~~~";
  set defaultstructuredssp true;
  set delaymaximumms 0;
  set dipolescale 1.0;
  set disablepopupmenu false;
  set displaycellparameters true;
  set dotdensity 3;
  set dotscale 1;
  set dotsselectedonly false;
  set dotsurface true;
  set doubleprecision false;
  set dragselected false;
  set drawfontsize 16.0;
  set drawhover false;
  set dsspcalculatehydrogenalways true;
  set ellipsoidarcs false;
  set ellipsoidarrows false;
  set ellipsoidaxes false;
  set ellipsoidaxisdiameter 0.02;
  set ellipsoidball true;
  set ellipsoiddotcount 200;
  set ellipsoiddots false;
  set ellipsoidfill false;
  set energyunits "kJ";
  set forceautobond false;
  set gestureswipefactor 1.0;
  set greyscalerendering false;
  set hbondhxdistancemaximum 2.5;
  set hbondsbackbone false;
  set hbondsrasmol true;
  set hbondssolid false;
  set helixstep 1;
  set helppath "https://chemapps.stolaf.edu/jmol/docs/index.htm";
  set hermitelevel 0;
  set hiddenlinesdashed false;
  set hidenameinpopup false;
  set hidenavigationpoint false;
  set highresolution false;
  set hoverdelay 0.3;
  set infofontsize 20;
  set isosurfacekey false;
  set isosurfacepropertysmoothing true;
  set isosurfacepropertysmoothingpower 7;
  set jmolinjspecview true;
  set justifymeasurements false;
  set labelpointerwidth 2;
  set loadatomdatatolerance 0.01;
  set measureallmodels false;
  set measurementlabels true;
  set meshscale 1;
  set messagestylechime false;
  set minbonddistance 0.4;
  set minimizationcriterion 0.001;
  set minimizationrefresh true;
  set minimizationsilent false;
  set minimizationsteps 100;
  set minpixelselradius 6;
  set modulationscale 1.0;
  set monitorenergy false;
  set multiplebondbananas false;
  set multiplebondradiusfactor 0.0;
  set multiplebondspacing -1.0;
  set navigationperiodic false;
  set navigationspeed 5.0;
  set nbocharges true;
  set nmrpredictformat "https://www.nmrdb.org/service/predictor?POST?molfile=";
  set nmrurlformat "https://www.nmrdb.org/new_predictor?POST?molfile=";
  set partialdots false;
  set particleradius 20.0;
  set pdbaddhydrogens false;
  set pdbgetheader false;
  set pdbsequential false;
  set percentvdwatom 23;
  set pickingspinrate 10;
  set pointgroupdistancetolerance 0.2;
  set pointgrouplineartolerance 8.0;
  set propertyatomnumbercolumncount 0;
  set propertyatomnumberfield 0;
  set propertycolorscheme "roygb";
  set propertydatacolumncount 0;
  set propertydatafield 0;
  set quaternionframe "p";
  set rangeselected false;
  set ribbonaspectratio 16;
  set ribbonborder false;
  set rocketbarrels false;
  set sheetsmoothing 1.0;
  set showhiddenselectionhalos false;
  set showhydrogens true;
  set showmeasurements true;
  set showmodulationvectors false;
  set showmultiplebonds true;
  set shownavigationpointalways false;
  set showunitcelldetails true;
  set slabbyatom false;
  set slabbymolecule false;
  set smallmoleculemaxatoms 40000;
  set smartaromatic true;
  set solventprobe false;
  set solventproberadius 1.2;
  set ssbondsbackbone false;
  set starwidth 0.05;
  set stereodegrees -5;
  set strandcountformeshribbon 7;
  set strandcountforstrands 5;
  set strutdefaultradius 0.3;
  set strutlengthmaximum 7.0;
  set strutsmultiple false;
  set strutspacing 6;
  set tracealpha true;
  set translucent true;
  set twistedsheets false;
  set usenumberlocalization true;
  set vectorscale 1.0;
  set vectorscentered false;
  set vectorsymmetry false;
  set vectortrail 0;
  set vibrationscale 1.0;
  set waitformoveto true;
  set wireframerotation false;
  set zdepth -800;
  set zoomheight false;
  set zoomlarge false;
  set zslab 50;

#user-defined atom sets; 
  @~all_unusual ({});
  @~anomalous_atoms ({});
  @~d_aa_ca ({});
  @~d_aas ({});
  @~hidden4hide_jdef ({});
  @~hidden4isolate_jdef ({});
  @~hidden_jdef ({});
  @~labeledcys ({});
  @~nonstandard_residue_ca ({});
  @~nonstandard_residues ({});
  @~nucleic ({});
  @~polynucleic ({});
  @~protein ({0:24239});

# label defaults;
  select none;
  color label none;
  background label none;
  set labelOffset 4 4;
  set labelAlignment left;
  set labelPointer off;
  font label 13 SansSerif Plain;

}

function _setDataState() {


}

function _setModelState() {

  select ({79 179 280 281 381 382 483 583 684 685 785 786 887 987 1088 1089 1189 1190 1291 1391 1492 1493 1593 1594 1695 1795 1896 1897 1997 1998 2099 2199 2300 2301 2401 2402 2503 2603 2704 2705 2805 2806 2907 3007 3108 3109 3209 3210 3311 3411 3512 3513 3613 3614 3715 3815 3916 3917 4017 4018 4119 4219 4320 4321 4421 4422 4523 4623 4724 4725 4825 4826 4927 5027 5128 5129 5229 5230 5331 5431 5532 5533 5633 5634 5735 5835 5936 5937 6037 6038 6139 6239 6340 6341 6441 6442 6543 6643 6744 6745 6845 6846 6947 7047 7148 7149 7249 7250 7351 7451 7552 7553 7653 7654 7755 7855 7956 7957 8057 8058 8159 8259 8360 8361 8461 8462 8563 8663 8764 8765 8865 8866 8967 9067 9168 9169 9269 9270 9371 9471 9572 9573 9673 9674 9775 9875 9976 9977 10077 10078 10179 10279 10380 10381 10481 10482 10583 10683 10784 10785 10885 10886 10987 11087 11188 11189 11289 11290 11391 11491 11592 11593 11693 11694 11795 11895 11996 11997 12097 12098 12199 12299 12400 12401 12501 12502 12603 12703 12804 12805 12905 12906 13007 13107 13208 13209 13309 13310 13411 13511 13612 13613 13713 13714 13815 13915 14016 14017 14117 14118 14219 14319 14420 14421 14521 14522 14623 14723 14824 14825 14925 14926 15027 15127 15228 15229 15329 15330 15431 15531 15632 15633 15733 15734 15835 15935 16036 16037 16137 16138 16239 16339 16440 16441 16541 16542 16643 16743 16844 16845 16945 16946 17047 17147 17248 17249 17349 17350 17451 17551 17652 17653 17753 17754 17855 17955 18056 18057 18157 18158 18259 18359 18460 18461 18561 18562 18663 18763 18864 18865 18965 18966 19067 19167 19268 19269 19369 19370 19471 19571 19672 19673 19773 19774 19875 19975 20076 20077 20177 20178 20279 20379 20480 20481 20581 20582 20683 20783 20884 20885 20985 20986 21087 21187 21288 21289 21389 21390 21491 21591 21692 21693 21793 21794 21895 21995 22096 22097 22197 22198 22299 22399 22500 22501 22601 22602 22703 22803 22904 22905 23005 23006 23107 23207 23308 23309 23409 23410 23511 23611 23712 23713 23813 23814 23915 24015 24116 24117 24217 24218});
  color atoms opaque [x40ff00];
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  color atoms opaque [x00ffe0];
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