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		<title>5phd - Revision history</title>
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			<title>OCA at 12:54, 6 March 2024</title>
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;In macromolecular crystallography, the rigorous detection of changed states (for example, ligand binding) is difficult unless signal is strong. Ambiguous ('weak' or 'noisy') density is experimentally common, since molecular states are generally only fractionally present in the crystal. Existing methodologies focus on generating maximally accurate maps whereby minor states become discernible; in practice, such map interpretation is disappointingly subjective, time-consuming and methodologically unsound. Here we report the PanDDA method, which automatically reveals clear electron density for the changed state-even from inaccurate maps-by subtracting a proportion of the confounding 'ground state'; changed states are objectively identified from statistical analysis of density distributions. The method is completely general, implying new best practice for all changed-state studies, including the routine collection of multiple ground-state crystals. More generally, these results demonstrate: the incompleteness of atomic models; that single data sets contain insufficient information to model them fully; and that accuracy requires further map-deconvolution approaches.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;A multi-crystal method for extracting obscured crystallographic states from conventionally uninterpretable electron density.,Pearce NM, Krojer T, Bradley AR, Collins P, Nowak RP, Talon R, Marsden BD, Kelm S, Shi J, Deane CM, von Delft F Nat Commun. 2017 Apr 24;8:15123. doi: 10.1038/ncomms15123. PMID:28436492&amp;lt;ref&amp;gt;PMID:28436492&amp;lt;/ref&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;div class=&amp;quot;pdbe-citations 5phd&amp;quot; style=&amp;quot;background-color:#fffaf0;&amp;quot;&amp;gt;&amp;lt;/div&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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			<pubDate>Wed, 06 Mar 2024 12:54:28 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA at 12:55, 17 January 2024</title>
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;StructureSection load='5phd' size='340' side='right' caption='[[5phd]], [[Resolution|resolution]] 1.36&amp;amp;Aring;' scene=''&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;+&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #cfc; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;StructureSection load='5phd' size='340' side='right'caption='[[5phd]], [[Resolution|resolution]] 1.36&amp;amp;Aring;' scene=''&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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			<pubDate>Wed, 17 Jan 2024 12:55:02 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA at 13:26, 6 November 2017</title>
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			<pubDate>Mon, 06 Nov 2017 13:26:25 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA at 09:37, 27 September 2017</title>
			<link>http://52.214.119.220/wiki/index.php?title=5phd&amp;diff=2767572&amp;oldid=prev</link>
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			<pubDate>Wed, 27 Sep 2017 09:37:42 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA at 21:23, 15 March 2017</title>
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			<pubDate>Wed, 15 Mar 2017 21:23:39 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA: Protected &quot;5phd&quot; [edit=sysop:move=sysop]</title>
			<link>http://52.214.119.220/wiki/index.php?title=5phd&amp;diff=2720801&amp;oldid=prev</link>
			<description>&lt;p&gt;Protected &amp;quot;&lt;a href=&quot;/wiki/index.php/5phd&quot; title=&quot;5phd&quot;&gt;5phd&lt;/a&gt;&amp;quot; [edit=sysop:move=sysop]&lt;/p&gt;

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			&lt;/tr&gt;
		&lt;/table&gt;</description>
			<pubDate>Thu, 09 Mar 2017 12:40:38 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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			<title>OCA: New page: '''Unreleased structure'''  The entry 5phd is ON HOLD   Authors: Krojer, T.  Description: PanDDA analysis group deposition --Crystal Structure of JMJD2D in complex with N09419a [[Category:...</title>
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&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;'''Unreleased structure'''&lt;br /&gt;
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The entry 5phd is ON HOLD &lt;br /&gt;
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Authors: Krojer, T.&lt;br /&gt;
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Description: PanDDA analysis group deposition --Crystal Structure of JMJD2D in complex with N09419a&lt;br /&gt;
[[Category: Unreleased Structures]]&lt;br /&gt;
[[Category: Krojer, T]]&lt;/div&gt;</description>
			<pubDate>Thu, 09 Mar 2017 12:40:37 GMT</pubDate>			<dc:creator>OCA</dc:creator>			<comments>http://52.214.119.220/wiki/index.php/Talk:5phd</comments>		</item>
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