Sand box groel - Revision history

Jaime Prilusky at 10:24, 20 October 2017

Jaime Prilusky — Fri, 20 Oct 2017 10:24:06 GMT

←Older revision		Revision as of 10:24, 20 October 2017
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
-	<Structure load='~~1AON~~' size='400' frame='true' align='left' caption='[[1aon]]'/>	+	<Structure load='1aon' size='400' frame='true' align='left' caption='[[1aon]]'/>

	<div dir='rtl' align='right'>		<div dir='rtl' align='right'>

Michal Harel at 10:26, 21 February 2016

Michal Harel — Sun, 21 Feb 2016 10:26:35 GMT

←Older revision		Revision as of 10:26, 21 February 2016
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
-	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>	+	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption='[[1aon]]'/>

	<div dir='rtl' align='right'>		<div dir='rtl' align='right'>

Shelly Livne at 13:49, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:49:29 GMT

←Older revision		Revision as of 13:49, 13 June 2012
Line 5:		Line 5:
	<p dir='rtl'>		<p dir='rtl'>
	חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.		חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.
-	~~<br>~~<br>	+	<br>

	[[מדוע צריכים שפרונים?]]<br>		[[מדוע צריכים שפרונים?]]<br>
Line 13:		Line 13:
	<br>		<br>
	2. בתא יש ריכוז גבוה של חלבונים שמפריע לקיפול נכון ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .		2. בתא יש ריכוז גבוה של חלבונים שמפריע לקיפול נכון ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .
-	~~<br>~~<br>	+	<br>

	נתמקד בשפרון הנקרא GROEL<br>		נתמקד בשפרון הנקרא GROEL<br>
	<scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene>
-	<br>~~<br>~~	+	<br>
-		+

	[[מבנה החלבון]]		[[מבנה החלבון]]
Line 30:		Line 29:

	<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene><br>		<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene><br>
-	<br><br><br><br><br><br>
	<br>		<br>
-	~~<Structure load='1AON' size='400' align='rigth' frame='true' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>~~	+
		+
	[[מנגנון הפעולה]] :<br>		[[מנגנון הפעולה]] :<br>

	אלוסטריה ב- GROEL - שינויי קונפורמציה בעקבות קישור		אלוסטריה ב- GROEL - שינויי קונפורמציה בעקבות קישור
	<br>1. ל-GROEL במצב R יש אפיניות גדולה ל- ATP .		<br>1. ל-GROEL במצב R יש אפיניות גדולה ל- ATP .
-	<br>2. ATP ~~נקשר~~ לטבעת אחת של GROEL והקונפורמציה של הטבעת עוברת ממצב R למצב T.	+	<br>2. מולקולת ATP נקשרת לטבעת אחת של GROEL והקונפורמציה של הטבעת עוברת ממצב R למצב T.
	<br>3. במצב T יש אפיניות גדולה יותר לפוליפפטידים. נקשר לאזורים הידרופוביים של החלבונים הלא מקופלים (או שמקופלים לא טוב).		<br>3. במצב T יש אפיניות גדולה יותר לפוליפפטידים. נקשר לאזורים הידרופוביים של החלבונים הלא מקופלים (או שמקופלים לא טוב).
-	<br> ה-GROES נקשר ל-GROEL ומכסה את החלל. מקבלים מבנה שדומה למבחנה עם מכסה (שהחלבון לכוד בפנים). ~~הGroES~~ מבודד את החלבון מהסביבה ונותן לו סביבה הידרופובית. בשלב זה הטבעת השניה לא קושרת בהעדר קונפורמציה מתאימה.	+	<br> ה-GROES נקשר ל-GROEL ומכסה את החלל. מקבלים מבנה שדומה למבחנה עם מכסה (שהחלבון לכוד בפנים). ה GroES מבודד את החלבון מהסביבה ונותן לו סביבה הידרופובית. בשלב זה הטבעת השניה לא קושרת בהעדר קונפורמציה מתאימה.
	<br>4. החלבון מתקפל בתוך החלל וה-ATP מתפרק ל-ADP+P ואז חוזרים למצב R . החלבון המקופל יוצא החוצה וכמו כן ה- GROES , לא לפני שהטבעת השניה מתחילה לקשור ATP וחוזר חלילה.		<br>4. החלבון מתקפל בתוך החלל וה-ATP מתפרק ל-ADP+P ואז חוזרים למצב R . החלבון המקופל יוצא החוצה וכמו כן ה- GROES , לא לפני שהטבעת השניה מתחילה לקשור ATP וחוזר חלילה.

Line 46:		Line 45:
	<br>		<br>

-	[[לסיכום:]]~~<br>~~	+	[[לסיכום:]]

	<br>• קיימת התאמה בין 2 הטבעות. קואופרטיביות שלילת : כשהאחת קשרה ATP השניה לא יכולה לקשור.		<br>• קיימת התאמה בין 2 הטבעות. קואופרטיביות שלילת : כשהאחת קשרה ATP השניה לא יכולה לקשור.

Shelly Livne at 13:40, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:40:36 GMT

←Older revision		Revision as of 13:40, 13 June 2012
Line 32:		Line 32:
	<br><br><br><br><br><br>		<br><br><br><br><br><br>
	<br>		<br>
-		+	<Structure load='1AON' size='400' align='rigth' frame='true' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>
	[[מנגנון הפעולה]] :<br>		[[מנגנון הפעולה]] :<br>

Line 44:		Line 44:
	<br>		<br>
	<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>
-	<br>~~<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>~~	+	<br>
		+
	[[לסיכום:]]<br>		[[לסיכום:]]<br>

Shelly Livne at 13:38, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:38:29 GMT

←Older revision		Revision as of 13:38, 13 June 2012
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
-	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption='~~'/><br>~~	+	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>
-	~~<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1~~'/>	+

	<div dir='rtl' align='right'>		<div dir='rtl' align='right'>
Line 45:		Line 44:
	<br>		<br>
	<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>
-	<br>	+	<br><Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>
	[[לסיכום:]]<br>		[[לסיכום:]]<br>

Shelly Livne at 13:37, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:37:47 GMT

←Older revision		Revision as of 13:37, 13 June 2012
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
-	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>	+	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/><br>
	<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>		<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>

Shelly Livne at 13:37, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:37:19 GMT

←Older revision		Revision as of 13:37, 13 June 2012
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>		<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>
		+	<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>
		+
	<div dir='rtl' align='right'>		<div dir='rtl' align='right'>
	<p dir='rtl'>		<p dir='rtl'>
Line 30:		Line 32:
	<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene><br>		<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene><br>
	<br><br><br><br><br><br>		<br><br><br><br><br><br>
-	<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>
	<br>		<br>

Shelly Livne at 13:35, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:35:49 GMT

←Older revision		Revision as of 13:35, 13 June 2012
Line 4:		Line 4:
	<p dir='rtl'>		<p dir='rtl'>
	חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.		חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.
-	<br>	+	<br><br>
-	~~נתמקד בשפרון הנקרא GROEL~~	+
-	<~~scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene~~>	+

-	[[מדוע צריכים שפרונים?]]	+	[[מדוע צריכים שפרונים?]]<br>

	1. לא כל החלבונים מתקפלים עצמאית		1. לא כל החלבונים מתקפלים עצמאית

		+	<br>
	2. בתא יש ריכוז גבוה של חלבונים שמפריע לקיפול נכון ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .		2. בתא יש ריכוז גבוה של חלבונים שמפריע לקיפול נכון ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .
		+	<br><br>
		+
		+	נתמקד בשפרון הנקרא GROEL<br>
		+	<scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene>
		+	<br><br>
		+

	[[מבנה החלבון]]		[[מבנה החלבון]]
		+	<br>

	החלבון נוצר מ- 14 תת-יחידות (מונומרים) מסודרות במבנה של 2 טבעות.		החלבון נוצר מ- 14 תת-יחידות (מונומרים) מסודרות במבנה של 2 טבעות.
-	כל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים.	+	<br>כל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים.
-	ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים.	+	ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים. <br>
	יש חלבון נוסף המסייע הנקרא GROES הסוגר את החלל מהווה מעין מכסה ל"מבחנה".		יש חלבון נוסף המסייע הנקרא GROES הסוגר את החלל מהווה מעין מכסה ל"מבחנה".
-	כך בתוך החלל יכול ליצור את האינטראקציות האופטימליות מבלי שיעשה אינטראקציות עם מולקולות אחרות.	+	<br>כך בתוך החלל יכול ליצור את האינטראקציות האופטימליות מבלי שיעשה אינטראקציות עם מולקולות אחרות.

-	<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene>	+	<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene><br>
		+	<br><br><br><br><br><br>
		+	<Structure load='1AON' size='400' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>
		+	<br>

-	~~<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>~~	+	[[מנגנון הפעולה]] :<br>
-		+
-		+
-	[[מנגנון הפעולה]] :	+

	אלוסטריה ב- GROEL - שינויי קונפורמציה בעקבות קישור		אלוסטריה ב- GROEL - שינויי קונפורמציה בעקבות קישור
-	1. ל-GROEL במצב R יש אפיניות גדולה ל- ATP .	+	<br>1. ל-GROEL במצב R יש אפיניות גדולה ל- ATP .
-	2. ATP נקשר לטבעת אחת של GROEL והקונפורמציה של הטבעת עוברת ממצב R למצב T.	+	<br>2. ATP נקשר לטבעת אחת של GROEL והקונפורמציה של הטבעת עוברת ממצב R למצב T.
-	3. במצב T יש אפיניות גדולה יותר לפוליפפטידים. נקשר לאזורים הידרופוביים של החלבונים הלא מקופלים (או שמקופלים לא טוב).	+	<br>3. במצב T יש אפיניות גדולה יותר לפוליפפטידים. נקשר לאזורים הידרופוביים של החלבונים הלא מקופלים (או שמקופלים לא טוב).
-	ה-GROES נקשר ל-GROEL ומכסה את החלל. מקבלים מבנה שדומה למבחנה עם מכסה (שהחלבון לכוד בפנים). הGroES מבודד את החלבון מהסביבה ונותן לו סביבה הידרופובית. בשלב זה הטבעת השניה לא קושרת בהעדר קונפורמציה מתאימה.	+	<br> ה-GROES נקשר ל-GROEL ומכסה את החלל. מקבלים מבנה שדומה למבחנה עם מכסה (שהחלבון לכוד בפנים). הGroES מבודד את החלבון מהסביבה ונותן לו סביבה הידרופובית. בשלב זה הטבעת השניה לא קושרת בהעדר קונפורמציה מתאימה.
-	4. החלבון מתקפל בתוך החלל וה-ATP מתפרק ל-ADP+P ואז חוזרים למצב R . החלבון המקופל יוצא החוצה וכמו כן ה- GROES , לא לפני שהטבעת השניה מתחילה לקשור ATP וחוזר חלילה.	+	<br>4. החלבון מתקפל בתוך החלל וה-ATP מתפרק ל-ADP+P ואז חוזרים למצב R . החלבון המקופל יוצא החוצה וכמו כן ה- GROES , לא לפני שהטבעת השניה מתחילה לקשור ATP וחוזר חלילה.
-		+

		+	<br>
	<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Adp_in_active_ring/2'>ADP IN GROEL RING</scene>
		+	<br>
		+	[[לסיכום:]]<br>

-	~~[[לסיכום:]]~~	+	<br>• קיימת התאמה בין 2 הטבעות. קואופרטיביות שלילת : כשהאחת קשרה ATP השניה לא יכולה לקשור.
-		+	<br>• הקישור לחלבון תלוי במצב הטבעת T/R
-	• קיימת התאמה בין 2 הטבעות. קואופרטיביות שלילת : כשהאחת קשרה ATP השניה לא יכולה לקשור.	+	<br>• בחלבון לא מקופל / לא מקופל היטב, האזורים ההידרופובים חשופים ועשויים להתקשר לטבעת GroEL במצב T. במצב Rהחלבון המקופל מתנתק.
-	• הקישור לחלבון תלוי במצב הטבעת T/R	+	<br>• GroEL אינו מראה ספציפיות רבה – כלומר נקשר לחלבונים רבים, שונים זה מזה. המוטיב המשותף היחיד לכל החלבונים הוא היותם פרושים, ולכן צפויים להמצא אזורים הידרופוביים החשופים לתמיסה החיצונית. לכן, האנטראקציה של GroEL עם החלבונים היא בעיקר באמצעות אנטראקציות הידרופוביות לא ספציפיות.
-	• בחלבון לא מקופל / לא מקופל היטב, האזורים ההידרופובים חשופים ועשויים להתקשר לטבעת GroEL במצב T. במצב Rהחלבון המקופל מתנתק.	+
-	• GroEL אינו מראה ספציפיות רבה – כלומר נקשר לחלבונים רבים, שונים זה מזה. המוטיב המשותף היחיד לכל החלבונים הוא היותם פרושים, ולכן צפויים להמצא אזורים הידרופוביים החשופים לתמיסה החיצונית. לכן, האנטראקציה של GroEL עם החלבונים היא בעיקר באמצעות אנטראקציות הידרופוביות לא ספציפיות.	+

Shelly Livne at 13:27, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:27:49 GMT

←Older revision		Revision as of 13:27, 13 June 2012
Line 5:		Line 5:
	חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.		חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.
	<br>		<br>
-	נתמקד בשפרון הנקרא	+	נתמקד בשפרון הנקרא GROEL
-	GROEL	+
	<scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Groel-groes/1'>GROEL-GROES COMPLEX</scene>

Line 25:		Line 24:
	<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene>		<scene name='Sand_box_groel/Groes/1'>GROES</scene>

-	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='~~right~~' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>	+	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption='' scene='Sand_box_groel/Groel-groes/1'/>

Shelly Livne at 13:26, 13 June 2012

Shelly Livne — Wed, 13 Jun 2012 13:26:10 GMT

←Older revision		Revision as of 13:26, 13 June 2012
Line 1:		Line 1:
	==[[GROEL השפרון]]==		==[[GROEL השפרון]]==
	<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>		<Structure load='1AON' size='400' frame='true' align='left' caption=''/>
-	חלבון סוכך -שפרון -הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה ~~מרחב~~ (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.	+	<div dir='rtl' align='right'>
		+	<p dir='rtl'>
		+	חלבון סוכך - שפרון - הוא חלבון המסייע למגוון רחב של חלבונים אחרים להתקפל למבנה מרחבי (מבנה שניוני ומבנה שלישוני( תקין, כאשר הוא עצמו אינו חלק מהמבנה הסופי שלהם. השפרונים מאפשרים לחלבונים תנאים מתאימים לקיפול. לא מקובל להתייחס לחלבון סוכך כאל אנזים למרות שהוא זרז של פעולת קיפול החלבונים. חלבון סוכך מכונה גם חלבון לוויה או חלבון מלווה. ישנם סוגים שונים של שפרונים.
		+	<br>
	נתמקד בשפרון הנקרא		נתמקד בשפרון הנקרא
	GROEL		GROEL
Line 10:		Line 13:
	1. לא כל החלבונים מתקפלים עצמאית		1. לא כל החלבונים מתקפלים עצמאית

-	2. בתא יש ריכוז ~~גבוהה~~ של חלבונים שמפריע לקיפול ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .	+	2. בתא יש ריכוז גבוה של חלבונים שמפריע לקיפול נכון ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון .

	[[מבנה החלבון]]		[[מבנה החלבון]]

-	החלבון נוצר מ- 14 תת ~~יחדות~~ (מונומרים) מסודרות במבנה של 2 טבעות.	+	החלבון נוצר מ- 14 תת-יחידות (מונומרים) מסודרות במבנה של 2 טבעות.
	כל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים.		כל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים.
	ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים.		ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים.