This old version of Proteopedia is provided for student assignments while the new version is undergoing repairs. Content and edits done in this old version of Proteopedia after March 1, 2026 will eventually be lost when it is retired in about June of 2026.
Apply for new accounts at the new Proteopedia. Your logins will work in both the old and new versions.
Sandbox-vp
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| (14 intermediate revisions not shown.) | |||
| Line 2: | Line 2: | ||
<StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''> | <StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''> | ||
<div dir='rtl'> | <div dir='rtl'> | ||
| + | [[Image:2gu2.png|right|260px|thumb]] | ||
| + | '''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate לאספרטאט ואצטאט [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%97%D7%95%D7%9E%D7%A8_%D7%9C%D7%91%D7%9F בחומר הלבן]'''. | ||
| + | מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה גנטית "[http://en.wikipedia.org/wiki/Canavan_disease קנוואן], ", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים. | ||
| - | '''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate לאספרטאט ואצטאט במוח הלבן| חומר לבן]][['''. | ||
| - | מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה גנטית "קנוואן", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים. | ||
| - | אנו מציגים מבנה גבישי של חלבון משוחלף של אדם ועכבר, ברזולוציה 2.8-1.8 אנגסטרם. החלבון בנוי משתי שרשראות. | ||
| - | המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 משטחי ביטא <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>מבנה הלבון משטחי בטא</scene> | ||
| - | הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי. | ||
| - | דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות. | ||
| - | ==תפקיד | + | ==תפקיד החלבון== |
| - | תפקיד | + | תפקיד החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט <ref name="UniProt">http://www.uniprot.org/uniprot/Q9R1T5</ref> : |
| + | N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate | ||
| - | N- | + | כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate ? |
| + | |||
| + | החלבון בנוי משתי שרשראות. המבנים חושפים [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_domain שהדומיין] של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני([http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_folding protein fold]) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות ([http://en.wikipedia.org/wiki/Carboxypeptidase_A Caraboxypeptidases A]). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי בטא</scene> (מסומנים בירוק) , שניתן לצפות בהם גם <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene> הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי. | ||
| + | דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.<ref name="Abstract"> PMID: 17194761</ref> | ||
==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן== | ==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן== | ||
זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן. | זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן. | ||
| - | המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. | + | המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. <ref name="canavan">http://genopedia.co.il/index.php/%D7%A7%D7%A0%D7%95%D7%95%D7%90%D7%9F</ref> |
| + | |||
| + | ==רפרנסים== | ||
| + | <references /> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==לקריאה נוספת== | ||
| + | [http://www.ynet.co.il/articles/0,7340,L-4319316,00.html ביה"ח טעה במי שפיר - התינוקת נולדה עם מחלה קטלנית] | ||
| + | |||
| + | |||
</div> | </div> | ||
</StructureSection> | </StructureSection> | ||
Current revision
(Aspartoacylase) אספרטואצילאז
| |||||||||||
