Myoglobin of Physeter catodon: structure
From Proteopedia
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- | <StructureSection load='3o89' size=' | + | <StructureSection load='3o89' size='400' side='right' caption='Mioglobina de cachalote' scene='60/602777/Mioglobina1/1'> |
+ | [[es:Myoglobin of Physeter catodon: structure (Spanish)]] | ||
+ | <big> | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina1/4'>Heme group</scene> | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina1/5'>Iron ion</scene> | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina2/1'>Ball and stick model</scene> | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina2/2'>Hide heme group</scene>. | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina2/3'>Polypeptide chain</scene> | ||
+ | ::Amino acids position in protein folding: | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina2/4'>Amino acids with positive charge</scene> | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina2/5'>Amino acids with negative charge</scene> | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina2/6'>Polar amino acids</scene> | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina2/7'>Non polar amino acids</scene> | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina2/9'>Whole protein</scene>. | ||
- | + | ::<scene name='60/602777/Mioglobina3/1'>Ball and stick model</scene> | |
- | + | ::Sencodary structure: | |
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina4/1'>alfa helix</scene> | ||
+ | :::<scene name='60/602777/Mioglobina4/2'>Chain turns</scene> | ||
- | En el modelo de la derecha se visualiza el esqueleto de la cadena polipeptídica junto con el gupo hemo. Veamos ahora la misma estructura en un <scene name='60/602777/Mioglobina2/1'>modelo de bolas y varillas</scene>. Los colores que se observan varían gradualmente desde el extremo amino-terminal (azul) al carboxi-terminal (verde). Para facilitar la visualización <scene name='60/602777/Mioglobina2/2'>ocultamos ahora el grupo hemo</scene>. | ||
- | Trataremos ahora de situar en | ||
- | <scene name='60/602777/Mioglobina2/3'>la cadena polipeptidica</scene> | ||
- | los distintos grupos de residuos de aminoácidos: | ||
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- | Los <scene name='60/602777/Mioglobina2/4'>residuos con carga negativa</scene> y los <scene name='60/602777/Mioglobina2/5'>residuos con carga positiva</scene> aparecen dispuestos en la periferia de la molécula, accesibles a las moléculas de agua circundantes. Lo mismo ocurre con los residuos de aminoácidos <scene name='60/602777/Mioglobina2/6'>polares</scene>. Por el contrario, los <scene name='60/602777/Mioglobina2/7'>residuos no polares</scene> aparecen dispuestos en el interior del plegamiento, recubiertos por los residuos con carga o de carácter polar, y aislados del contacto con las moléculas de agua circundantes, tal como se puede apreciar en esta representación de <scene name='60/602777/Mioglobina2/9'>todos los residuos</scene>. También se aprecia aquí que la molécula presenta un plegamiento muy compacto, sin apenas espacio para moléculas de agua en su interior. | ||
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- | Partiendo de nuevo del modelo de <scene name='60/602777/Mioglobina3/1'>bolas y varillas</scene> trataremos ahora de apreciar otros aspectos del plegamiento de la mioglobina. En un modelo de cintas se aprecia que existen 7 tramos rectilíneos con estructura secundaria en <scene name='60/602777/Mioglobina4/1'>helice alfa</scene>, separados por <scene name='60/602777/Mioglobina4/2'>curvaturas</scene> sin estructura secundaria aparente. | ||
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- | Por último, restituyamos <scene name='60/602777/Mioglobina5/1'>el grupo hemo</scene> a su lugar. | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina5/1'>Heme group on</scene> | ||
+ | ::<scene name='60/602777/Mioglobina1/1'>Back to initial view</scene> | ||
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== References == | == References == | ||
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