User:Cristiane Custodio Ross Matheus/Sandbox 1

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'''OhrR''' é um fator transcricional caracterizado por ser uma proteína repressora e o principal fator regulatório do gene Ohr na maioria dos microrganismos. Essa proteína se encontra sobre o promotor do gene da Ohr e tem a sua estrutura alterada quando oxidada, ao entrar em contato com hidroperóxidos de ácidos graxos e peroxinitritos. Com a mudança de conformação gerada pela oxidação da OhrR ocorre o seu desprendimento do promotor do gene, fazendo com que o mesmo se torne mais acessível a RNA polimerase, ocorrendo por consequência uma superexpressão do gene da Ohr. Além da OhrR também foram encontrados em alguns microrganismos meios regulatórios distintos para o gene da Ohr. Um exemplo é a regulação positiva pelo fator sigma alternativo, presente em alguns microrganismos
'''OhrR''' é um fator transcricional caracterizado por ser uma proteína repressora e o principal fator regulatório do gene Ohr na maioria dos microrganismos. Essa proteína se encontra sobre o promotor do gene da Ohr e tem a sua estrutura alterada quando oxidada, ao entrar em contato com hidroperóxidos de ácidos graxos e peroxinitritos. Com a mudança de conformação gerada pela oxidação da OhrR ocorre o seu desprendimento do promotor do gene, fazendo com que o mesmo se torne mais acessível a RNA polimerase, ocorrendo por consequência uma superexpressão do gene da Ohr. Além da OhrR também foram encontrados em alguns microrganismos meios regulatórios distintos para o gene da Ohr. Um exemplo é a regulação positiva pelo fator sigma alternativo, presente em alguns microrganismos
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==Structural features==
==Structural features==
Ohr apresenta características estruturais e bioquímicas distintas quando comparada a peroxidases baseadas em Cys de mamíferos. Essa proteína apresenta estrutura semelhante à de um barril formada por um homodímero firmemente dobrado, no qual duas folhas β, de seis fitas, envolvem duas α-hélices centrais. Há dois locais ativos na enzima que se encontram localizados na interface do dímero em lados opostos da proteína. A arquitetura do sítio catalítico de Ohr é composta por duas cisteínas, a peroxidática e a de resolução. A Cisteína peroxidática, localizada em uma das α-hélices centrais, tem por função a reação direta com hidroperóxidos, formando um ácido sulfênico. Este por sua vez se condensa com a Cisteína de resolução para formar uma ligação dissulfeto intramolecular. Além dos dois aminoácidos de Cys há também a presença de uma Arginina catalítica e um Glutamato que tem extrema importância na atividade da enzima Ohr, uma vez que ajudam a estabilizar a Cys em seu estado de tiolato através de interações polares, aumentando sua nucleofilicidade. O grupo carboxílico do glutamato catalítico orienta o grupo guanidínio da Arginina em direção a Cisteína, em uma configuração que parece ser ideal para a redução de hidroperóxidos orgânicos. Esse processo de estabilização descrito é o chamado estado fechado da tríade catalítica. No estado aberto ocorre o rompimento das interações e consequente mudança conformacional que acaba expondo o resíduo ao solvente, sendo esse último estado o mais propício para a redução da Ohr
Ohr apresenta características estruturais e bioquímicas distintas quando comparada a peroxidases baseadas em Cys de mamíferos. Essa proteína apresenta estrutura semelhante à de um barril formada por um homodímero firmemente dobrado, no qual duas folhas β, de seis fitas, envolvem duas α-hélices centrais. Há dois locais ativos na enzima que se encontram localizados na interface do dímero em lados opostos da proteína. A arquitetura do sítio catalítico de Ohr é composta por duas cisteínas, a peroxidática e a de resolução. A Cisteína peroxidática, localizada em uma das α-hélices centrais, tem por função a reação direta com hidroperóxidos, formando um ácido sulfênico. Este por sua vez se condensa com a Cisteína de resolução para formar uma ligação dissulfeto intramolecular. Além dos dois aminoácidos de Cys há também a presença de uma Arginina catalítica e um Glutamato que tem extrema importância na atividade da enzima Ohr, uma vez que ajudam a estabilizar a Cys em seu estado de tiolato através de interações polares, aumentando sua nucleofilicidade. O grupo carboxílico do glutamato catalítico orienta o grupo guanidínio da Arginina em direção a Cisteína, em uma configuração que parece ser ideal para a redução de hidroperóxidos orgânicos. Esse processo de estabilização descrito é o chamado estado fechado da tríade catalítica. No estado aberto ocorre o rompimento das interações e consequente mudança conformacional que acaba expondo o resíduo ao solvente, sendo esse último estado o mais propício para a redução da Ohr
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==3D structures of Ohr==
==3D structures of Ohr==
[[Organic hydroperoxide resistance protein]]
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Revision as of 11:44, 7 December 2021

Organic Hydroperoxide Resistance Protein (PDB code 1ZB9).

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