Lípidos

El grupo carboxilico

El representa el máximo grado de oxidación de un carbono orgánico respecto al oxígeno. Se trata de un carbono unido a un grupo hidroxilo y un grupo carbonilo. Esta molécula corresponde del ácido fórmico, el ácido orgánico más simple de la naturaleza. Vemos como se trata de una estructura plana donde el carbono y el oxígeno del carbonilo presentan hibridación sp2, con ángulos de aprox 120 grados. El orbital p no hibridado de carbono y oxígeno forman el orbital molecular pi que la da carácter de doble enlace. Esta estructura plana contrasta con la del , donde existe hibridación sp3 y geometría tetrahédrica no plana.
La imagen de densidad de carga de la molécula de ácido fórmico ofrece clara polaridad entre la parte negativa del carbonilo (rojiza) y la más positiva del hidrógeno y el carbono (azul-verdosa)
La oxidación posterior de un grupo carboxílico lleva a la formación de y la ruptura de la cadena del compuesto orgánico. Si observamos el siguiente àcido orgánico en número de carbonos el vemos que el carbono del grupo y el oxígeno con doble enlace presentan hibridación sp2 mientras el otro carbono y el otro oxígeno tienen hibridación sp3. Cuando se produce la desprotonación del grupo carboxílico actuando como ácido, y se forma , ambos oxígenos pasan a tener hibridación sp2 y se forma una estructura plana resonante estable

Ácidos grasos

Los son ácidos orgánicos formados por largas cadenas hidrocarbonadas y un grupo funcional carboxilo en el extremo. En este caso se trata del ácido palmítico, acido graso saturado de 16 carbonos. Esta representación es una de las infinitas conformaciones que podemos encontrar en estas moléculas. solo difiere en la libre rotación de dos enlaces simples. Sin embargo, cuando existe un la molécula ya no puede rotar alrededor de este enlace y se introduce un acodamiento fijo. En este caso se trata de un doble enlace en configuración cis ( en amarillo), ya que ambas cadenas se hallan al mismo lado del doble enlace. Los enlaces cis son los habituales en los ácidos grasos biológicos. Aquí vemos un ácido graso con un doble (sabeis dar el nombre?). Los PUFAS, son ácidos grasos poliinsaturados, por ejemplo el . Estos ácidos con varios dobles enlaces se les denomina según la posición del último doble enlace y su distancia con el último carbono, el carbono omega. Así, el linoléico es un ácido Omega 3, ya que el último enlace doble está entre el carbono 3 y el 4 empezando por el final. Este otro es el , con cuatro dobles enlaces. En este caso se trata de un ácido omega 6

Grasas

Los ácidos grasos son moléculas anfipáticas con una cabeza polar y una cola hidrocarbonada apolar. Cuando se almacenan en las células del tejido adiposo lo hacen como . En ellos, cada OH del glicerol forma un enlace ester con el grupo carboxilo de un ácido graso

Prostaglandinas, ciclooxigenasa y aspirina

Las son moléculas con fuerte acción farmacológica, como hormonas locales secretadas por las células en la inflamación mediando la fiebre, la inflamación, el dolor etc. Derivan del ácido araquidónico y possen 20 carbonos con grupos oxidados y un anillo saturado. Esta es la prostaglandina D2 y podemos observar la presencia de un doble enlace trans. El número que acompaña a la letra indica el número de dobles enlaces fuera del anillo. Esta prostaglandina tiene dos dobles enlaces y por tanto es D2.
La síntesis de las prostaglandinas es llevada a cabo por la enzima . En esta escena vemos el grupo hemo responsable de la catálisis en rojo y el substrato, ácido araquidónico en naranja entrando en el canal de la enzima para aproximarse al centro activo. No obstante, este canal es mucho más estrecho de lo que parece, tal como muestra la siguiente visualización en la que vemos la . De hecho, el araquidonico está en el interior y apenas lo vemos salvo por el punto de acceso al canal. Si por en medio vemos más fácilmente el canal. La aspirina actua acetilando un residuo de serina, la serina 530. se encuentra en en el centro del canal del ácido araquidónico. Cuando la serina está acetilada por acción de la aspirina, el acido araquidónico no puede entrar en el canal y la enzima es inactiva. Es un efecto irreversible que perdura hasta que se sintetizan nuveas moléculas de enzima

Esteroides

Structural highlights

This is a sample scene created with SAT to by Group, and another to make of the protein. You can make your own scenes on SAT starting from scratch or loading and editing one of these sample scenes.