Gramicidin Channel in Lipid Bilayer (Spanish)
From Proteopedia
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<table style="background-color:#ffffc0" cellpadding="8" width="95%" border="0"><tr><td valign='top'>[[Image:Note.gif|left]] '''Modelo teórico:''' | <table style="background-color:#ffffc0" cellpadding="8" width="95%" border="0"><tr><td valign='top'>[[Image:Note.gif|left]] '''Modelo teórico:''' | ||
La estructura descrita en esta página se ha determinado [[theoretical_models|teóricamente]] y, por tanto, debe interpretarse con precaución.</td></tr></table> | La estructura descrita en esta página se ha determinado [[theoretical_models|teóricamente]] y, por tanto, debe interpretarse con precaución.</td></tr></table> | ||
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+ | __TOC__ | ||
+ | <StructureSection load='3rec' size='400' side='right' caption='Modelo teórico de gramicidina en una bicapa lipídica (de fosfatidiletanolamina).' scene='38/388990/Protein_only/1'> | ||
- | + | Se muestran aquí dos moléculas del péptido gramicidina (con 15 residuos aminoácidos cada una) tal como se cree que se disponen al formar un canal a través de la membrana de bicapa lipídica<ref>PMID: 7529578</ref> (<scene name='38/388990/Protein_only/1'>recuperar la escena inicial</scene>). La forma y el volumen de la proteína se muestran con una superficie punteada, y dentro de ella mediante un cordón y una cinta se representa la trayectoria del esqueleto peptídico, o línea que conecta los átomos de carbono alfa de cada aminoácido. | |
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- | <li>Mostrar <scene name=' | + | <li>Mostrar <scene name='38/388990/Protein_backbone/1'>sólo el esqueleto</scene> de las cadenas peptídicas de gramicidina. En este experimento las cadenas estaban unidas mediante una molécula de dioxolano ({{Template:ColorKey_Element_C}}, {{Template:ColorKey_Element_O}}). |
</li> | </li> | ||
- | <li><scene name=' | + | <li><scene name='38/388990/Gramicidin_in_bilayer/1'>Mostrar una porción de la bicapa lipídica.</scene> {{Template:ColorKey_Element_C}}, {{Template:ColorKey_Element_H}}, {{Template:ColorKey_Element_O}}, {{Template:ColorKey_Element_N}}, {{Template:ColorKey_Element_P}} |
- | </li><li>Mostrar <scene name=' | + | <br>(Se ha omitido la mayoría de los átomos de hidrógeno.) |
+ | </li> | ||
+ | <li>Mostrar <scene name='38/388990/Gramicidin_bilayer_water/1'>el agua</scene>. Observa cómo las "colas" hidrófobas de los lípidos excluyen el agua. | ||
</li> | </li> | ||
<li>El agua pasa | <li>El agua pasa | ||
- | <scene name=' | + | <scene name='38/388990/Water_through_channel/1'>a través del canal</scene>. |
- | </li><li> | + | </li> |
- | Mostrar <scene name=' | + | <li>Mostrar <scene name='38/388990/Water_only/1'>sólo el agua</scene>. |
- | </li><li> | + | </li> |
- | Mostrar sólo | + | <li>Mostrar sólo |
- | <scene name=' | + | <scene name='38/388990/2pl_2water/1'>2 moléculas de fosfolípido y 2 de agua</scene>. |
+ | {{Template:ColorKey_Element_C}}, {{Template:ColorKey_Element_H}}, {{Template:ColorKey_Element_O}}, {{Template:ColorKey_Element_N}}, {{Template:ColorKey_Element_P}} | ||
+ | <br>Hay una explicación de su estructura en la [http://biomodel.uah.es/model2/bicapa guía detallada]. | ||
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+ | <div style="background-color:pink;padding:6px; width:90%; margin-left:5%;">Para agrandar las escenas moleculares, recuerda usar el botón `'''popup'''´ y luego redimensionar la ventana emergente.</div> | ||
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==Véase también== | ==Véase también== | ||
- | * Una explicación detallada y una guía sobre [http://biomodel.uah.es/model2/ | + | * Una explicación detallada y una guía sobre [http://biomodel.uah.es/model2/bicapa Bicapa lipídica y canal de gramicidina]. |
- | * [http://firstglance.jmol.org/fg.htm?mol= | + | * [http://firstglance.jmol.org/fg.htm?mol=bilagram.pdb.gz Este modelo en FirstGlance in Jmol] (en inglés). Asegúrate de pulsar los botones ''Ligands+'' y ''Water''. |
* [http://bme3d.molviz.org/ BioMolecular Explorer 3D], un recurso (en inglés y español) para profesores de secundaria que incluye una sección sobre la gramicidina en una bicapa lipídica. | * [http://bme3d.molviz.org/ BioMolecular Explorer 3D], un recurso (en inglés y español) para profesores de secundaria que incluye una sección sobre la gramicidina en una bicapa lipídica. | ||
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Current revision
Canal de gramicidina en bicapa lipídica
Modelo teórico: La estructura descrita en esta página se ha determinado teóricamente y, por tanto, debe interpretarse con precaución. |
Contents |
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Para agrandar las escenas moleculares, recuerda usar el botón `popup´ y luego redimensionar la ventana emergente.
Véase también
- Una explicación detallada y una guía sobre Bicapa lipídica y canal de gramicidina.
- Este modelo en FirstGlance in Jmol (en inglés). Asegúrate de pulsar los botones Ligands+ y Water.
- BioMolecular Explorer 3D, un recurso (en inglés y español) para profesores de secundaria que incluye una sección sobre la gramicidina en una bicapa lipídica.
- Recursos para profesores de secundaria
- La versión en inglés de esta página: Gramicidin Channel in Lipid Bilayer (English version of this page).
Notas
- El archivo PDB mostrado aquí, Image:Gramicidin in bilayer.pdb.gz, fue generosamente proporcionado por Serge Crouzy.
Referencias
- ↑ Crouzy S, Woolf TB, Roux B. A molecular dynamics study of gating in dioxolane-linked gramicidin A channels. Biophys J. 1994 Oct;67(4):1370-86. PMID:7529578 doi:http://dx.doi.org/10.1016/S0006-3495(94)80618-6