We apologize for Proteopedia being slow to respond. For the past two years, a new implementation of Proteopedia has been being built. Soon, it will replace this 18-year old system. All existing content will be moved to the new system at a date that will be announced here.
Sandbox-vp
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| (24 intermediate revisions not shown.) | |||
| Line 2: | Line 2: | ||
<StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''> | <StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''> | ||
<div dir='rtl'> | <div dir='rtl'> | ||
| + | [[Image:2gu2.png|right|260px|thumb]] | ||
| + | '''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate לאספרטאט ואצטאט [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%97%D7%95%D7%9E%D7%A8_%D7%9C%D7%91%D7%9F בחומר הלבן]'''. | ||
| + | מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה גנטית "[http://en.wikipedia.org/wiki/Canavan_disease קנוואן], ", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים. | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==תפקיד החלבון== | ||
| + | תפקיד החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט <ref name="UniProt">http://www.uniprot.org/uniprot/Q9R1T5</ref> : | ||
| + | N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate | ||
| + | |||
| + | כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate ? | ||
| + | |||
| + | החלבון בנוי משתי שרשראות. המבנים חושפים [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_domain שהדומיין] של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני([http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_folding protein fold]) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות ([http://en.wikipedia.org/wiki/Carboxypeptidase_A Caraboxypeptidases A]). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי בטא</scene> (מסומנים בירוק) , שניתן לצפות בהם גם <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene> הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי. | ||
| + | דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.<ref name="Abstract"> PMID: 17194761</ref> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן== | ||
| + | זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן. | ||
| + | המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. <ref name="canavan">http://genopedia.co.il/index.php/%D7%A7%D7%A0%D7%95%D7%95%D7%90%D7%9F</ref> | ||
| + | |||
| + | ==רפרנסים== | ||
| + | <references /> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==לקריאה נוספת== | ||
| + | [http://www.ynet.co.il/articles/0,7340,L-4319316,00.html ביה"ח טעה במי שפיר - התינוקת נולדה עם מחלה קטלנית] | ||
| + | |||
| + | |||
| - | '''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate לאספרטאט ואצטאט במוח הלבן. | ||
| - | מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה גנטית "קנוואן", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים. | ||
| - | אנו מציגים מבנה גבישי של חלבון משוחלף של אדם ועכבר, ברזולוציה 2.8-1.8 אנגסטרם. | ||
| - | המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A).''' | ||
</div> | </div> | ||
</StructureSection> | </StructureSection> | ||
Current revision
(Aspartoacylase) אספרטואצילאז
| |||||||||||
