We apologize for Proteopedia being slow to respond. For the past two years, a new implementation of Proteopedia has been being built. Soon, it will replace this 18-year old system. All existing content will be moved to the new system at a date that will be announced here.

Sandbox-moshe

From Proteopedia

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (00:47, 6 January 2013) (edit) (undo)
 
(33 intermediate revisions not shown.)
Line 1: Line 1:
-
מה קורה כשמחממים ביצה
+
מה קורה כשמחממים ביצה
-
<StructureSection load='1OVA' size='350' side='center' caption='Structure מודל של מונומר של אינסולין'
+
-
scene = 'ו בואו דבר על אינסולין'=
+
-
</StructureSection>
+
-
<scene name='Sandbox-moshe/Ball_and_sticks/1'>מודל מקלות וכדורים</scene>
+
----
 +
 
 +
<StructureSection load=' 1VAC' size='350' side='center' caption='Structure מודל של חלבון האובלבומין'>
 +
<scene name='Sandbox-moshe/הידרופובייםOvalbumin/2'>The Ovalbumin proteine</scene>
 +
 
 +
מולקולות האובלבומין הן שרשרָאות ארוכות אשר יחידות המבנה שלהן
 +
הן <scene name='Sandbox-moshe/Component_of_ovalbunin/1'>חומצות אמינו</scene> הקשורות [http://www.youtube.com/watch?v=cgf1l3YQPXo בקשרים פפטידיים]. מבנה
 +
המולקולה מיוצב על ידי קשרי ואן דר ואלס, קשרי מימן <scene name='Sandbox-moshe/Sulfur_bonds/3'>וקשרי גופרית</scene>, בין חלקים שונים של השרשרת והשיירים השונים
 +
של חומצות האמינו. בעת החימום חלקים שונים במולקולות
 +
מתחילים לנוע וכך משתנה הקונפורמציה של המולקולות.
 +
הסידור המרחבי שלהן משתנה כי קשרים שיצרו את המבנה
 +
הכדורי נשברים והמולקולות נפרשות )עוברות דהנטורציה(.
 +
אפשר לדמיין את מולקולות החלבון בדמות יחידות של ספגטי
 +
המתפתלות וזזות במים. המבנה הפרוש חושף חלקים רבים
 +
במולקולות האלבומין, חלקם הידרופיליים וחלקם <scene name='Sandbox-moshe/Hydrophobic_parts/1'>הידרופוביים</scene>,
 +
שמאפשרים יצירת קשרים עם מולקולות מים ומולקולות
 +
אלבומין אחרות בצורה אקראית. כך מתקבל מבנה מולקולרי
 +
תלת-מְמדי, רֶשֶׁת של מולקולות אשר לוכדות מולקולות
 +
מים. החומר שמתקבל צפיד. ככל שהטמפרטורה עולה וזמן
 +
הבישול מתארך, כך עולה מספרן של מולקולות המים היוצאות
 +
מהמבנה, וכך מולקולות האלבומין נקשרות זו לזו במוקדים
 +
רבים יותר עד שמתקבל מבנה מוצק – גומי )איורים 5-6 (.
 +
החלבון הקשה אינו משנה את צורתו ואינו מושפע יותר מעליית
 +
הטמפרטורה, אלא אם נשרוף את הביצה.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
Molecular Characteristics:
 +
 
 +
Ovalbumin consists of <scene name='Sandbox-moshe/385_amino_acids/1'>385 amino acid residues</scene> (Nisbet et al. 1981). It is unique in that its signal sequence is in the middle of the polypeptide chain <scene name='Sandbox-moshe/Signal_sequence/2'>(234-252 residues</scene>) (Lingappa et al. 1979). Interestingly, ovalbumin has been found to have sequence homology with a group of proteinase inhibitors called [http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=53 serpins] (30% homology with the archetype member of the family, <scene name='Sandbox-moshe/Alpha1-antitrypsin/4'>Alpha1-antitrypsin</scene> (Hunt and Dayhoff 1980).
 +
----
 +
 
 +
Composition:
 +
 
 +
Ovalbumin has <scene name='Sandbox-moshe/Cysteine_residues/1'>four cysteine residues and a single cystine disulfide bridge</scene> (Stevens 1991). Electrophoretic separation shows three ovalbumin bands (Lush 1961). These three bands correspond to the dephosphorylated, monophosphorylated, and diphosphorylated forms. <scene name='Sandbox-moshe/Two_phosphorylation_sites/1'>The phosphorylation</scene> sites are Ser68 and Ser344. A carbohydrate moiety is linked through Asn292. The N-terminus is acetylated. Two polymorphic forms of ovalbumin are known (ovalbumin A and ovalbumin B). Ovalbumin A has an asparagine at position 311, while ovalbumin B has an aspartic acid (Stevens 1991).
 +
 
 +
<scene name='Sandbox-moshe/Ramachandran_plot/1'>Ramachandran_plot</scene>
 +
 
 +
Protein Accession Number: P01012
 +
 
 +
Molecular Weight: 85.5 kDa (Theoretical)
 +
 
 +
Isoelectric Point: 4.5 (Stevens 1991)
 +
 
 +
Extinction Coefficient:
 +
 
 +
61,180 cm-1M-1
 +
E1%,280 = 7.16 (Theoretical)
 +
Applications:
 +
 
 +
----
 +
Medicinal characteristics:
 +
In cases where poisoning by heavy metals (such as Iron) is suspected, ovalbumin may be administered. Ovalbumin chelates to heavy metals and traps the metal ions within the <scene name='Sandbox-moshe/Cysteine_residues/1'>sulfhydryl bonds of the protein</scene>. Chelating prevents the absorption of the metals into the gastrointestinal tract and prevents poisoning.
 +
<scene name='Sandbox-moshe/Ovalbumin/2'>The Ovalbumin proteine</scene>
 +
</StructureSection>

Current revision

מה קורה כשמחממים ביצה


Structure מודל של חלבון האובלבומין

Drag the structure with the mouse to rotate
Personal tools