We apologize for Proteopedia being slow to respond. For the past two years, a new implementation of Proteopedia has been being built. Soon, it will replace this 18-year old system. All existing content will be moved to the new system at a date that will be announced here.
Sandbox-moshe
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| (33 intermediate revisions not shown.) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
| - | + | מה קורה כשמחממים ביצה | |
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | <scene name='Sandbox-moshe/ | + | ---- |
| + | |||
| + | <StructureSection load=' 1VAC' size='350' side='center' caption='Structure מודל של חלבון האובלבומין'> | ||
| + | <scene name='Sandbox-moshe/הידרופובייםOvalbumin/2'>The Ovalbumin proteine</scene> | ||
| + | |||
| + | מולקולות האובלבומין הן שרשרָאות ארוכות אשר יחידות המבנה שלהן | ||
| + | הן <scene name='Sandbox-moshe/Component_of_ovalbunin/1'>חומצות אמינו</scene> הקשורות [http://www.youtube.com/watch?v=cgf1l3YQPXo בקשרים פפטידיים]. מבנה | ||
| + | המולקולה מיוצב על ידי קשרי ואן דר ואלס, קשרי מימן <scene name='Sandbox-moshe/Sulfur_bonds/3'>וקשרי גופרית</scene>, בין חלקים שונים של השרשרת והשיירים השונים | ||
| + | של חומצות האמינו. בעת החימום חלקים שונים במולקולות | ||
| + | מתחילים לנוע וכך משתנה הקונפורמציה של המולקולות. | ||
| + | הסידור המרחבי שלהן משתנה כי קשרים שיצרו את המבנה | ||
| + | הכדורי נשברים והמולקולות נפרשות )עוברות דהנטורציה(. | ||
| + | אפשר לדמיין את מולקולות החלבון בדמות יחידות של ספגטי | ||
| + | המתפתלות וזזות במים. המבנה הפרוש חושף חלקים רבים | ||
| + | במולקולות האלבומין, חלקם הידרופיליים וחלקם <scene name='Sandbox-moshe/Hydrophobic_parts/1'>הידרופוביים</scene>, | ||
| + | שמאפשרים יצירת קשרים עם מולקולות מים ומולקולות | ||
| + | אלבומין אחרות בצורה אקראית. כך מתקבל מבנה מולקולרי | ||
| + | תלת-מְמדי, רֶשֶׁת של מולקולות אשר לוכדות מולקולות | ||
| + | מים. החומר שמתקבל צפיד. ככל שהטמפרטורה עולה וזמן | ||
| + | הבישול מתארך, כך עולה מספרן של מולקולות המים היוצאות | ||
| + | מהמבנה, וכך מולקולות האלבומין נקשרות זו לזו במוקדים | ||
| + | רבים יותר עד שמתקבל מבנה מוצק – גומי )איורים 5-6 (. | ||
| + | החלבון הקשה אינו משנה את צורתו ואינו מושפע יותר מעליית | ||
| + | הטמפרטורה, אלא אם נשרוף את הביצה. | ||
| + | |||
| + | ---- | ||
| + | |||
| + | Molecular Characteristics: | ||
| + | |||
| + | Ovalbumin consists of <scene name='Sandbox-moshe/385_amino_acids/1'>385 amino acid residues</scene> (Nisbet et al. 1981). It is unique in that its signal sequence is in the middle of the polypeptide chain <scene name='Sandbox-moshe/Signal_sequence/2'>(234-252 residues</scene>) (Lingappa et al. 1979). Interestingly, ovalbumin has been found to have sequence homology with a group of proteinase inhibitors called [http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=53 serpins] (30% homology with the archetype member of the family, <scene name='Sandbox-moshe/Alpha1-antitrypsin/4'>Alpha1-antitrypsin</scene> (Hunt and Dayhoff 1980). | ||
| + | ---- | ||
| + | |||
| + | Composition: | ||
| + | |||
| + | Ovalbumin has <scene name='Sandbox-moshe/Cysteine_residues/1'>four cysteine residues and a single cystine disulfide bridge</scene> (Stevens 1991). Electrophoretic separation shows three ovalbumin bands (Lush 1961). These three bands correspond to the dephosphorylated, monophosphorylated, and diphosphorylated forms. <scene name='Sandbox-moshe/Two_phosphorylation_sites/1'>The phosphorylation</scene> sites are Ser68 and Ser344. A carbohydrate moiety is linked through Asn292. The N-terminus is acetylated. Two polymorphic forms of ovalbumin are known (ovalbumin A and ovalbumin B). Ovalbumin A has an asparagine at position 311, while ovalbumin B has an aspartic acid (Stevens 1991). | ||
| + | |||
| + | <scene name='Sandbox-moshe/Ramachandran_plot/1'>Ramachandran_plot</scene> | ||
| + | |||
| + | Protein Accession Number: P01012 | ||
| + | |||
| + | Molecular Weight: 85.5 kDa (Theoretical) | ||
| + | |||
| + | Isoelectric Point: 4.5 (Stevens 1991) | ||
| + | |||
| + | Extinction Coefficient: | ||
| + | |||
| + | 61,180 cm-1M-1 | ||
| + | E1%,280 = 7.16 (Theoretical) | ||
| + | Applications: | ||
| + | |||
| + | ---- | ||
| + | Medicinal characteristics: | ||
| + | In cases where poisoning by heavy metals (such as Iron) is suspected, ovalbumin may be administered. Ovalbumin chelates to heavy metals and traps the metal ions within the <scene name='Sandbox-moshe/Cysteine_residues/1'>sulfhydryl bonds of the protein</scene>. Chelating prevents the absorption of the metals into the gastrointestinal tract and prevents poisoning. | ||
| + | <scene name='Sandbox-moshe/Ovalbumin/2'>The Ovalbumin proteine</scene> | ||
| + | </StructureSection> | ||
Current revision
מה קורה כשמחממים ביצה
| |||||||||||
