Sandbox- duaa2
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| (3 intermediate revisions not shown.) | |||
| Line 15: | Line 15: | ||
==מבנה שניוני של הקולגן== | ==מבנה שניוני של הקולגן== | ||
לקולגן יש מבנה שניוני <scene name='Sandbox-_duaa2/Left-handed_helix/4'> left-handed helix</scene> אורך סיבוב אחד 10 אנגרוסרטום יש 3.3 | לקולגן יש מבנה שניוני <scene name='Sandbox-_duaa2/Left-handed_helix/4'> left-handed helix</scene> אורך סיבוב אחד 10 אנגרוסרטום יש 3.3 | ||
| - | <scene name='Collagen/Peptide_3_residue_segments/1'>3.3 שיירים בכל סיבוב</scene>. רואים בתמונה את הגליצין באדום, הפרולין בירוק והידרוקסיפרולין בצהוב. כל שרשרת מבין השלושה, היא שמאלית, בעת ששלושת השרשרות ביחד הן סליל ימני. בשונה מסליל רגיל שבו יש 3.6 שיירים בכל סיבוב , ואורך סיבוב אחד הוא 5.4 אנגסטרום, בקולגן יש דווקא פחות שיירים בכל סיבוב , ואורך הסיבוב גדול יותר מסליל רגיל. הדבר נובע מהימצאות הפרולין שמגביל את יכולת הפיתול של השרשרת, דבר שגורם לשרשרת להיות יותר מתוחה, או במלים מדוייקות יותר : פחות "מסולסלת" . | + | <scene name='Collagen/Peptide_3_residue_segments/1'>3.3 שיירים בכל סיבוב</scene>. רואים בתמונה את הגליצין באדום, הפרולין בירוק והידרוקסיפרולין בצהוב. כל שרשרת מבין השלושה, היא שמאלית, בעת ששלושת השרשרות ביחד הן סליל ימני. בשונה מסליל רגיל שבו יש 3.6 שיירים בכל סיבוב , ואורך סיבוב אחד הוא 5.4 אנגסטרום, בקולגן יש דווקא פחות שיירים בכל סיבוב , ואורך הסיבוב גדול יותר מסליל רגיל. הדבר נובע מהימצאות הפרולין שמגביל את יכולת הפיתול של השרשרת, דבר שגורם לשרשרת להיות יותר מתוחה, או במלים מדוייקות יותר : פחות "מסולסלת" .זאת הסיבה לעצם היותו של הקולגן : לא גמיש ובעל חוזק מתיחה רב. (זה הקשר בין המבנה לתפקיד) |
<div dir='rtl'> | <div dir='rtl'> | ||
==מבנה רביעוני של הקולגן== | ==מבנה רביעוני של הקולגן== | ||
קולגן עשוי להיות מורכב משרשרת אחת, שתי שרשראות, שלוש, ארבע או חמש שרשראות שהן מקבילות מלופפות אחת סביב השנייה ליצור היליקס ימני. אנחנו נדגיש את השרשראת כשכל שרשרשת מופיעה בצבע אחר . | קולגן עשוי להיות מורכב משרשרת אחת, שתי שרשראות, שלוש, ארבע או חמש שרשראות שהן מקבילות מלופפות אחת סביב השנייה ליצור היליקס ימני. אנחנו נדגיש את השרשראת כשכל שרשרשת מופיעה בצבע אחר . | ||
<scene name='Sandbox-_duaa2/Spacefill_structure/1'>TextToBeמבנה ממלא מרחב של השרשראות</scene>. | <scene name='Sandbox-_duaa2/Spacefill_structure/1'>TextToBeמבנה ממלא מרחב של השרשראות</scene>. | ||
| - | שרשרות האלפא בקולגן מתכנסות סביב ציר מרכזי בדרך כזו שכל שיירי הגליצין ממוקמים במרכז ההילקס הבנוי משלושת השרשרות.לעומת זאת, קבוצות הצד של שאר חומצות האמינו פונות כלפי חוץ.ארגון זה מאפשר אריזה צפופה לאורך הציר המרכזי של המולקולה. נוכחות ההידרוקסיפרולין חיונית למען היווצרות אינטראקציות בין השרשרות, ותורמת ליציבות מבנה ההילקס. ניתן לראות בתמונה המצורפת מטה, את קשרי המימן הנוצרים בין השרשרות: בין מימן חשוף מאלקטרונים בגליצין (מימן שקשור | + | שרשרות האלפא בקולגן מתכנסות סביב ציר מרכזי בדרך כזו שכל שיירי הגליצין ממוקמים במרכז ההילקס הבנוי משלושת השרשרות.לעומת זאת, קבוצות הצד של שאר חומצות האמינו פונות כלפי חוץ.ארגון זה מאפשר אריזה צפופה לאורך הציר המרכזי של המולקולה. נוכחות ההידרוקסיפרולין חיונית למען היווצרות אינטראקציות בין השרשרות, ותורמת ליציבות מבנה ההילקס. ניתן לראות בתמונה המצורפת מטה, את קשרי המימן הנוצרים בין השרשרות: בין מימן חשוף מאלקטרונים בגליצין (מימן שקשור לחנקן) בשרשרת אחת, וזוג אלקטרונים לא קושר של החמצן בקרבוניל בפרולין בשרשרת שנייה <span dir='ltr'> N-H(Gly)...O=C(Pro)</span> . |
[[Image:collagen.png|center|thumb|300px|תיאור קישרי המימן בין שלושת השרשרות שמרכיבות את הקולגן]], | [[Image:collagen.png|center|thumb|300px|תיאור קישרי המימן בין שלושת השרשרות שמרכיבות את הקולגן]], | ||
<div dir='rtl'> | <div dir='rtl'> | ||
| Line 37: | Line 37: | ||
=מחקרים סביב הקולגן = | =מחקרים סביב הקולגן = | ||
בשנת 2006 הצליחו המדענים לסנתז קולגן מלאכותי במעבדה - שדומה לקולגן האנושי. המדענים התקדמו צעד נוסף במסלול מחקר זה ויצרו סוג קולגן חזק במיוחד שיוכל בעתיד לסייע למיליוני אנשים. החוקר הראשי אומר כי קולגן מלאכותי טומן בתוכו הבטחה לשמש כטיפול במצבים רפואיים כגון דלקת פרקיים, הנגרמת בשל התפרקותו של הקולגן הטבעי בגוף האדם.מחלה המשפיעה על קרוב לחמישים מיליוני אמריקאים.למרות שהקולגן המלאכותי מורכב ברובו מחומצות אמינו שאינן קיימות בטבע, קריסטלוגרפיה בקרני-רנטגן מאששת כי המבנה התלת-מימדי של החלבון המלאכותי בלתי-נבדל מהמבנה של מקבילו הטבעי. <br> | בשנת 2006 הצליחו המדענים לסנתז קולגן מלאכותי במעבדה - שדומה לקולגן האנושי. המדענים התקדמו צעד נוסף במסלול מחקר זה ויצרו סוג קולגן חזק במיוחד שיוכל בעתיד לסייע למיליוני אנשים. החוקר הראשי אומר כי קולגן מלאכותי טומן בתוכו הבטחה לשמש כטיפול במצבים רפואיים כגון דלקת פרקיים, הנגרמת בשל התפרקותו של הקולגן הטבעי בגוף האדם.מחלה המשפיעה על קרוב לחמישים מיליוני אמריקאים.למרות שהקולגן המלאכותי מורכב ברובו מחומצות אמינו שאינן קיימות בטבע, קריסטלוגרפיה בקרני-רנטגן מאששת כי המבנה התלת-מימדי של החלבון המלאכותי בלתי-נבדל מהמבנה של מקבילו הטבעי. <br> | ||
| - | רפרנסים <BR> | + | =רפרנסים = |
| + | <BR> | ||
http://www.proteopedia.org/wiki/index.php/Collagen<BR> | http://www.proteopedia.org/wiki/index.php/Collagen<BR> | ||
http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%92%D7%9F<BR> | http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%92%D7%9F<BR> | ||
Current revision
= קולגן- מבנה ותפקיד (Collagen- structure and function) =
| |||||||||||
