Lysozyme (hebrew)

From Proteopedia

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (11:25, 10 April 2020) (edit) (undo)
 
(11 intermediate revisions not shown.)
Line 1: Line 1:
==<center>'''ליזוזים'''</center>==
==<center>'''ליזוזים'''</center>==
-
<StructureSection load='1hew' size='350' side='left' scene='78/786672/Opening/5' caption='Glycosylated hen egg white lysozyme (PDB code [[1hew]])'>
+
<StructureSection load='1hew' size='350' side='left' scene='78/786672/Opening/9' caption='Glycosylated hen egg white lysozyme (PDB code [[1hew]])'>
==<center>היכרות עם הליזוזים</center>==
==<center>היכרות עם הליזוזים</center>==
Line 60: Line 60:
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
<scene name='78/786672/H_bond/1'>קשרי המימן</scene> הינם קשרים חיוניים לייצובו של כל חלבון. במודל המוצג ניתן להבחין בקשרים אלו, המודגשים בצבע כתום, ותורמים לייצוב המבנה המרחבי (התלת ממדי) של אנזים הליזוזים. קשרים נוספים שניתן לזהות בחלבון הליזוזים הם קשרים דיסולפידים (קשרי גופרית) בין כל שתי חומצות אמיניות ציסטאין. בליזוזים קיימים ארבעה <scene name='78/786672/Ss_bonds/3'>קשרים דיסולפידים</scene> המודגשים בצבע צהוב (העיגולים מייצגים את אטום הגופרית בציסטאין). גם קשרים אלו נועדו לייצוב במבנה המרחבי של המולקולה וממוקמים בין: Cys 6 ל- Cys 127, בין Cys 30 ל- Cys 115, בין Cys 64 ל- Cys 80 ובין Cys 76 ל-Cys 94. חשיבותם של קשרים אלו למבנה המרחבי ולתפקוד המולקולה באה לידי ביטוי בשימור הקשרים בכל מולקולות הליזוזים בקבוצות אורגניזמים שונות.
+
<scene name='78/786672/H_bond/2'>קשרי המימן</scene> הינם קשרים חיוניים לייצובו של כל חלבון. במודל המוצג ניתן להבחין בקשרים אלו, המודגשים בצבע שחור, ותורמים לייצוב המבנה המרחבי (התלת ממדי) של אנזים הליזוזים. קשרים נוספים שניתן לזהות בחלבון הליזוזים הם קשרים דיסולפידים (קשרי גופרית) בין כל שתי חומצות אמיניות ציסטאין. בליזוזים קיימים ארבעה <scene name='78/786672/Ss_bonds/6'>קשרים דיסולפידים</scene> המודגשים בצבע צהוב (העיגולים השחורים מייצגים את אטום הגופרית בציסטאין). גם קשרים אלו נועדו לייצוב במבנה המרחבי של המולקולה וממוקמים בין: Cys 6 ל- Cys 127, בין Cys 30 ל- Cys 115, בין Cys 64 ל- Cys 80 ובין Cys 76 ל-Cys 94. חשיבותם של קשרים אלו למבנה המרחבי ולתפקוד המולקולה באה לידי ביטוי בשימור הקשרים בכל מולקולות הליזוזים בקבוצות אורגניזמים שונות.
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
Line 78: Line 78:
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
<scene name='78/786672/Active_site/3'>האתר הפעיל</scene> של הליזוזים נראה כמרווח בין Glu 35 (מודגשת בצבע ירוק) ל- Asp 52 (מודגשת בצבע אדום). בחלל שנוצר מתמקם הסובסטרט - השרשרת הפוליסכרידית. למעשה, מולקולת הסובסטרט מונה 6 פחמניים. כלומר, מולקולת פוליסכריד בעל 6 טבעות סוכריות שמסודרות בצורת NAM-NAG. החיתוך נעשה בין הסוכר הרביעי לחמישי. <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1_hexamer/7'>בסצנה הבאה</scene> נראה ליזוזים מחלבון ביצת תרנגול, ביחד עם הסובסטרט שלו – שרשרת 6 פחמנית. סוכרי השרשרת מסומנים באותיות A-F ומיוצגים על ידי מקלות וכדורים. (חשוב לציין שמודל השרשת ה-6 פחמנית כולל רק יחידות NAG ונבנה באופן מלאכותי .)
+
<scene name='78/786672/Active_site/4'>האתר הפעיל</scene> של הליזוזים נראה כמרווח בין Glu 35 (מודגשת ) ל- Asp 52 (מודגשת ). בחלל שנוצר מתמקם הסובסטרט - השרשרת הפוליסכרידית. למעשה, מולקולת הסובסטרט מונה 6 פחמניים. כלומר, מולקולת פוליסכריד בעל 6 טבעות סוכריות שמסודרות בצורת NAM-NAG. החיתוך נעשה בין הסוכר הרביעי לחמישי. <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1_hexamer/7'>בסצנה הבאה</scene> נראה ליזוזים מחלבון ביצת תרנגול, ביחד עם הסובסטרט שלו – שרשרת 6 פחמנית. סוכרי השרשרת מסומנים באותיות A-F ומיוצגים על ידי מקלות וכדורים. (חשוב לציין שמודל השרשת ה-6 פחמנית כולל רק יחידות NAG ונבנה באופן מלאכותי .)
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
'''העיכוב''' של פעולת הליזוזים יכול להיעשות על ידי מולקולת "מעכב" שבנויה משרשרת סוכרית קטנה יותר בעלת 3 סוכרי NAG. מולקולת <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1/15'>המעכב</scene> מסוגלת להיקשר לאתר הפעיל וליצור קומפלקס של מעכב-אנזים. המעכב, שמיוצג במודל של מקלות וכדורים, בולט מתוך האתר הפעיל של הליזוזים ומהווה [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%9E%D7%A2%D7%9B%D7%91%D7%99_%D7%90%D7%A0%D7%96%D7%99%D7%9E%D7%99%D7%9D מעכב תחרותי] לסובסטרט. מולקולת המעכב, קטנה יותר ומתחרה עם הסובסטרט על האתר הפעיל. למרות שמולקולת המעכב נקשרת לאתר הפעיל, לא מתאפשר הזירוז של פירוקו. הסיבה נעוצה בכך שהמעכב נקשר לאתרים A-C, אך לא מגיע לאתרים E ו-D שבהם נעשה החיתוך ההידרוליטי על ידי Glu 35 ו- Asp 52. ניתן לעבור בין מודל <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1_hexamer/7'>הליזוזים עם הסובסטרט</scene> למודל <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1/15'>הליזוזים עם המעכב</scene> לצורך הבנת מיקומם של הסובסטרט והמעכב באתר הפעיל של הליזוזים.
+
'''העיכוב''' של פעולת הליזוזים יכול להיעשות על ידי מולקולת "מעכב" שבנויה משרשרת סוכרית קטנה יותר בעלת 3 סוכרי NAG. מולקולת <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1/15'>המעכב</scene> מסוגלת להיקשר לאתר הפעיל וליצור קומפלקס של מעכב-אנזים. המעכב, שמיוצג במודל של מקלות וכדורים, בולט מתוך האתר הפעיל של הליזוזים ומהווה [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%9E%D7%A2%D7%9B%D7%91%D7%99_%D7%90%D7%A0%D7%96%D7%99%D7%9E%D7%99%D7%9D מעכב תחרותי] לסובסטרט. מולקולת המעכב, קטנה יותר מהסובסטרט ומתחרה איתו על האתר הפעיל. למרות שמולקולת המעכב נקשרת לאתר הפעיל, לא מתאפשר הזירוז של פירוקו. הסיבה נעוצה בכך שהמעכב בנוי מאתרים A-C, אך לא מכיל אתרים E ו-D שבהם נעשה החיתוך ההידרוליטי על ידי Glu 35 ו- Asp 52. ניתן לעבור בין מודל <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1_hexamer/7'>הליזוזים עם הסובסטרט</scene> למודל <scene name='User:Judy_Voet/Lysozyme/Lysozyme1/15'>הליזוזים עם המעכב</scene> לצורך הבנת מיקומם של הסובסטרט והמעכב באתר הפעיל של הליזוזים.
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
==<center>דף עבודה לתמיד</center>==
+
==<center>דף עבודה לתלמיד</center>==
</p>
</p>
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
[http://proteopedia.org/wiki/images/1/14/Lysozyme.pdf דף עבודה לתלמיד]
+
[http://proteopedia.org/wiki/images/9/9d/%D7%90%D7%95%D7%A8%D7%9C%D7%99_%D7%95%D7%A9%D7%99%D7%A8%D7%94_%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94.pdf דף עבודה לתלמיד]
</p>
</p>
Line 96: Line 96:
<references/>
<references/>
</p>
</p>
 +
[[ar:Lysozyme (Arabic)]]
 +
[[en:Lysozyme]]

Current revision

ליזוזים

Glycosylated hen egg white lysozyme (PDB code 1hew)

Drag the structure with the mouse to rotate

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Orly Eliyahu, Shira Politzer, Joel L. Sussman

Retrieved from "http://52.214.119.220/wiki/index.php/Lysozyme_%28hebrew%29"
Personal tools
In other languages