NF-kB (hebrew)

From Proteopedia

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (21:18, 2 July 2018) (edit) (undo)
 
(54 intermediate revisions not shown.)
Line 1: Line 1:
-
==<center>'''פקטור שעתוק NF-kB'''</center>==
+
==<center>'''גורם שעתוק NF-kB'''</center>==
 +
<StructureSection load='1svc' size='400' side='left' scene='78/788816/P65_and_p50/9'>
-
<StructureSection load='1svc' size='400' side='left' scene='78/788816/P65_and_p50/1'>
 
==<center>'''רקע'''</center>==
==<center>'''רקע'''</center>==
Line 8: Line 8:
'''N'''uclear '''F'''actor '''k'''appa-light-chain-enhancer of activated '''B''' cells) '''NF-kB'''
'''N'''uclear '''F'''actor '''k'''appa-light-chain-enhancer of activated '''B''' cells) '''NF-kB'''
-
המהווה
+
הוא
-
[https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%95%D7%A8%D7%9D_%D7%A9%D7%A2%D7%AA%D7%95%D7%A7 גורם שעתוק גנים] (חלבון הנקשר לרצף DNA ספציפי, הנמצא לפני החלק המקודד של הגן, ובכך משפיע על שעתוק הגן לmRNA).
+
[https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%95%D7%A8%D7%9D_%D7%A9%D7%A2%D7%AA%D7%95%D7%A7 גורם שעתוק] (חלבון הנקשר לרצף DNA ספציפי, הנמצא לפני החלק המקודד של הגן, ובכך משפיע על שעתוק הגן לmRNA).
<br>
<br>
-
מורכב מחלבונים ממשפחת חלבונים שנקראים '''Rel''', המשותף בינהם שכולם נקשרים לDNA ומהווים [https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/life_sci/%D7%94%D7%A9%D7%A2%D7%AA%D7%95%D7%A7-%E2%80%93-%D7%99%D7%A6%D7%99%D7%A8%D7%AA-%D7%AA%D7%91%D7%A0%D7%99%D7%AA-rna פקטורי שעתוק גנים] (בסרטון שבקישור זה תוכלו לצפות בשחקנים נוספים ההכרחים בשעתוק גנים חוץ מהDNA וחלבון המשעתק- RNA פולימראז קיימים חלבונים נוספים הנקראים פקטורי שעתוק).
+
NF-kB מורכב מחלבונים ממשפחת חלבונים שנקראים
 +
'''Rel''', המשותף בינהם שכולם נקשרים לDNA ומהווים [https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/life_sci/%D7%94%D7%A9%D7%A2%D7%AA%D7%95%D7%A7-%E2%80%93-%D7%99%D7%A6%D7%99%D7%A8%D7%AA-%D7%AA%D7%91%D7%A0%D7%99%D7%AA-rna גורמי שעתוק גנים] (בסרטון שבקישור זה תוכלו לצפות בשחקנים נוספים ההכרחים בשעתוק גנים בנוסף לDNA וחלבון המשעתק- RNA פולימראז, קיימים חלבונים נוספים הנקראים פקטורי שעתוק).
<br>
<br>
'''NF-kB מורכב מחמישה סוגי חלבונים '''
'''NF-kB מורכב מחמישה סוגי חלבונים '''
Line 18: Line 19:
<br>
<br>
-
כאשר צירופים של סוגים אלו, יוצרים סוגי קומפלקסים [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%93%D7%99%D7%9E%D7%A8 הטרודימרים או הומודימרים] שונים של NF-kB , בעלי תיפקודים שונים.
+
צירופים של סוגים אלו, יוצרים סוגי קומפלקסים [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%93%D7%99%D7%9E%D7%A8 הטרודימרים או הומודימרים] שונים של NF-kB , בעלי תיפקודים שונים.
<br><br>
<br><br>
[[Image:סוגי חלבוני NFKB.png]]
[[Image:סוגי חלבוני NFKB.png]]
Line 24: Line 25:
-
בערך זה מוצג החלבון ,'''<scene name='78/788816/P50/4'>P50</scene>''', אחד מהחלבונים המרכיבים את NFKB. החלבון שמוצג שמקורו מאדם גובש בשיטת [https://davidson.weizmann.ac.il/online/askexpert/life_sci/%D7%9E%D7%94%D7%99-%D7%A7%D7%A8%D7%99%D7%A1%D7%98%D7%9C%D7%95%D7%92%D7%A8%D7%A4%D7%99%D7%94-%D7%95%D7%9B%D7%99%D7%A6%D7%93-%D7%94%D7%99%D7%90-%D7%A7%D7%A9%D7%95%D7%A8%D7%94-%D7%9C%D7%9E%D7%A6%D7%99%D7%90%D7%AA-%D7%9E%D7%91%D7%A0%D7%94-%D7%94%D7%A8%D7%99%D7%91%D7%95%D7%96%D7%95%D7%9D-%D7%90%D7%99%D7%AA%D7%9D קריסטלוגרפיה] יחד עם מולקולת DNA קצרה. בסצנה שלפניכם מוצג מונומר (תת יחידה אחת) של חלבון זה ומולקולת ה DNA הקשורה אליו.
+
בערך זה מוצג החלבון ,'''<scene name='78/788816/P50/4'>P50</scene>''' ( לפניכם מוצג מונומר- תת יחידה אחת בצבע ירוק של חלבון זה ומולקולת הDNA קשורה אליו) , אחד מהחלבונים המרכיבים את NFKB. החלבון שמוצג שמקורו מאדם גובש בשיטת [https://davidson.weizmann.ac.il/online/askexpert/life_sci/%D7%9E%D7%94%D7%99-%D7%A7%D7%A8%D7%99%D7%A1%D7%98%D7%9C%D7%95%D7%92%D7%A8%D7%A4%D7%99%D7%94-%D7%95%D7%9B%D7%99%D7%A6%D7%93-%D7%94%D7%99%D7%90-%D7%A7%D7%A9%D7%95%D7%A8%D7%94-%D7%9C%D7%9E%D7%A6%D7%99%D7%90%D7%AA-%D7%9E%D7%91%D7%A0%D7%94-%D7%94%D7%A8%D7%99%D7%91%D7%95%D7%96%D7%95%D7%9D-%D7%90%D7%99%D7%AA%D7%9D קריסטלוגרפיה] יחד עם מולקולת DNA קצרה.
<br>
<br>
Line 32: Line 33:
<br>
<br>
-
בהמשך המחקר הסתבר שפעילות אקסוגנית (סיגנלים המעבירים מסרים מחוץ לתא אל פנים התא) גורמים לשיפעול NF-kB הנמצא בציטופלזמה של כל סוגי התאים בגוף, וכן זוהו אתרי קישור יעודים ל NF-kB בפרומוטורים (אזור קדם שיעתוק) של גנים רבים,
+
בהמשך המחקר הסתבר שסיגנלים שונים גורמים להפעלת החלבון בציטופלזמה של כל סוגי התאים בגוף.
-
 
+
כמו כן זוהו אתרי קישור יעודים ל NF-kB בפרומוטורים (אזורי קדם שיעתוק) של גנים רבים.
-
כיום ידוע כי P50 הוא גורם בקרה, פקטור שעתוק [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A4%D7%9C%D7%99%D7%90%D7%95%D7%98%D7%A8%D7%95%D7%A4%D7%99%D7%94 פליאוטרופי] חשוב.
+
כיום ידוע כי P50 הוא גורם בקרה
 +
,פקטור שעתוק [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A4%D7%9C%D7%99%D7%90%D7%95%D7%98%D7%A8%D7%95%D7%A4%D7%99%D7%94 פליאוטרופי] חשוב.
Line 41: Line 43:
הפעלת תגובות חיסוניות ודלקתיות , בתגובות למצבי דחק וויסות תהליכי התרבות מהירה של תאים (פרוליפרציה) ותהליכי תמותת תאים מתוכננת ([https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/life_sci/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%99%D7%A1-%E2%80%93-%D7%9B%D7%A9%D7%94%D7%AA%D7%90-%D7%9E%D7%97%D7%9C%D7%99%D7%98-%D7%9C%D7%94%D7%AA%D7%90%D7%91%D7%93 אפופטוזיס]), גדילה, התמיינות והתפתחות תאים, התפתחות עוברית, פיזיולוגיה של העצם, העור ומערכת העצבים.
הפעלת תגובות חיסוניות ודלקתיות , בתגובות למצבי דחק וויסות תהליכי התרבות מהירה של תאים (פרוליפרציה) ותהליכי תמותת תאים מתוכננת ([https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/life_sci/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%99%D7%A1-%E2%80%93-%D7%9B%D7%A9%D7%94%D7%AA%D7%90-%D7%9E%D7%97%D7%9C%D7%99%D7%98-%D7%9C%D7%94%D7%AA%D7%90%D7%91%D7%93 אפופטוזיס]), גדילה, התמיינות והתפתחות תאים, התפתחות עוברית, פיזיולוגיה של העצם, העור ומערכת העצבים.
<br>
<br>
-
השראת הפעלה של NF-kB נצפתה גם בעקבות חשיפה למצבים פיזיקליים כמו קרינת גמא או קרינת UV.
+
הפעלה של NF-kB נצפתה גם בעקבות חשיפה למצבים פיזיקליים כמו קרינת גמא או קרינת UV.
<br>
<br>
-
כך, המצאות NF-Kb ופעילותו, חיונית לפעילות מגוונת הנגרמת כתוצאה מגירויים חיצוניים שונים ומהווה אלמנט מרכזי בתהליכים פיזיולוגיים ופתולוגיים מגוונים ובכל סוגי התאים.
+
המצאות NF-Kb ופעילותו, חיוניות לתגובה לגירויים חיצוניים שונים ומהווה אלמנט מרכזי בתהליכים פיזיולוגיים ופתולוגיים מגוונים ובכל סוגי התאים.
<br><br>
<br><br>
Line 61: Line 63:
במבנה שמוצג נראה <scene name='78/788816/P65_and_p50_and_dna_hide/1'>הומודימר המורכב משתי תת יחידות של P50</scene> העוטפות את הDNA (המסומן באדום).
במבנה שמוצג נראה <scene name='78/788816/P65_and_p50_and_dna_hide/1'>הומודימר המורכב משתי תת יחידות של P50</scene> העוטפות את הDNA (המסומן באדום).
<br><br>
<br><br>
-
כל חלבון בנוי משרשרת של חומצות אמיניות המכילה <scene name='78/788816/Amini_and_karboksil/1'>קצה אמיני וקצה קרבוקסיל</scene>
+
כל חלבון בנוי משרשרת של חומצות אמיניות המכילה <scene name='78/788816/Amini_and_karboksil/2'>קצה אמיני וקצה קרבוקסילי</scene>
,החלבונים מתקפלים ליצירת מבנה מרחבי יחודי לכל חלבון.
,החלבונים מתקפלים ליצירת מבנה מרחבי יחודי לכל חלבון.
<br>
<br>
[[Image:קצה_N_C.png]]
[[Image:קצה_N_C.png]]
<br>
<br>
-
אורך החלבון P50 מורכב מ<scene name='78/788816/P50_with_aa/2'>364 חומצות אמיניות</scene>,
+
[בסרגל שלפניכם מוצגים צבעי הקצוות של החלבון , באדום הקצה הקרבוקסילי , בכחול הקצה האמיני, הצבעים האחרים מסמלים קרבה או ריחוק מקצוות אלה]
-
בסצנה שלפניכם מוצגת כל סוג של חומצת אמינו בצע אחר
+
<br><br>
 +
החלבון P50 מורכב מ<scene name='78/788816/Aa/1'>364 חומצות אמיניות</scene>,
 +
בסצנה שלפניכם מוצגת כל סוג של חומצת אמינו בצע אחר.
<br><br>
<br><br>
-
'''ניתן לזהות במבנה השניוני של החלבון:''' מבני <scene name='78/788816/P50_alpha_helix_dna_hide/1'>סלילי אלפא</scene> (Alpha Helix), מבני <scene name='78/788816/P50_beta_sheet_dna_hide/1'>משטחי ביתא</scene> (Beta Sheet) <scene name='78/788816/P50_non_defined/2'>ומבנים לא מוגדרים</scene>, כאשר <scene name='78/788816/Active_site_red/1'>אתר הקישור</scene> של P50 עם הDNA מורכב מחלבונים שמבנם לא מוגדר (המבנים של אתר הקישור מסומנים בצבע אדום) .
+
'''ניתן לזהות במבנה השניוני של החלבון:''' מבני <scene name='78/788816/P50_alpha_helix/3'>סלילי אלפא</scene> (Alpha Helix), מבני <scene name='78/788816/P50_beta_sheet/3'>משטחי ביתא</scene> (Beta Sheet) <scene name='78/788816/P50_no_helix_and_sheet/2'>ומבנים לא מוגדרים</scene>, כאשר <scene name='78/788816/P50/8'>אתר הקישור</scene> של P50 עם הDNA מורכב מחלבונים שמבנם לא מוגדר (המבנים של אתר הקישור מסומנים בצבע אדום) .
<br><br>
<br><br>
'''בחלבון p50 ניתן לזהות מספר אתרים חשובים:
'''בחלבון p50 ניתן לזהות מספר אתרים חשובים:
Line 77: Line 81:
אורכו 300 חומצות אמיניות. מאופיינים בשני אתרים מרוחקים הנקשרים לDNA , מבנה RHD כמן כנף של פרפר המתחלק לשני אזורים, קטן והשני גדול ממנו:
אורכו 300 חומצות אמיניות. מאופיינים בשני אתרים מרוחקים הנקשרים לDNA , מבנה RHD כמן כנף של פרפר המתחלק לשני אזורים, קטן והשני גדול ממנו:
<br>
<br>
-
'''האתר הקטן''' יותר <scene name='78/788816/C_terminal/1'>בקצה הקרבוקסילי</scene>- (245-366 חומצות אמיניות) C-terminal '''מסומן בצבע אדום''', יוצר את שטח המגע ומספר אינטראקציות
+
'''האתר הקטן''' יותר <scene name='78/788816/N_terminal/3'>הקצה הקרבוקסילי</scene>- (245-366 חומצות אמיניות) C-terminal '''מסומן בצבע אדום''', יוצר את שטח המגע ומספר אינטראקציות
בין פוספט ל DNA.
בין פוספט ל DNA.
<br>
<br>
-
'''האתר הגדול''' יותר <scene name='78/788816/C_terminal/2'>הקצה האמיני</scene> (2-244 חומצות אמיניות )- N-terminal '''מסומן בצבע כחול''', יוצר לולאת היכרות המגיבה עם בסיסי ה DNA.
+
'''האתר הגדול''' יותר <scene name='78/788816/C_terminal/4'>הקצה האמיני</scene> (2-244 חומצות אמיניות )- N-terminal '''מסומן בצבע כחול''', יוצר לולאת היכרות המגיבה עם בסיסי ה DNA.
<br>
<br>
-
<scene name='78/788816/Aa_43/1'>השייר 43</scene> - Proline (בצבע כחול עם הילה צהובה), מהווה תחילת ה RHD ותחילת הקצה האמיני.
+
<scene name='78/788816/Aa_43/4'>השייר 43</scene> - Proline (בצבע כחול עם הילה צהובה), מהווה תחילת ה RHD ותחילת הקצה האמיני.
-
 
+
<br><br>
-
</p>
+
2. '''אתר הקישור המעכב של NF-kB-'''
-
 
+
'''IkB''' הינו חלבון המעכב את שפעול החלבון NF-kB בציטופלזמה.
-
 
+
<br><br>
-
<p dir='rtl'>
+
3.''' אתר מבני סלילי אלפא חלקי-'''
 +
<scene name='78/788816/160-205/2'>שיירים 160-205</scene>(מסומנים בצבע כחול) אינם חלק מרצף ההסכמה של חלבוני Rel, והם יוצרים מבנה קומפקטי של סלילי אלפא חלקי בתוך האתר.
-
דיאגרמה סכמטית של האינטראקציות הפולריות בין p50 ו 11bp של ה DNA. אינטראקציות בין החלבון לבין ה DNA מסומנות בחיצים. אינטראקציות בתוך החלבון מסומנות בקים. His 67, His 144, Lys 244- אינם זהים בין p50 ל p65.
 
-
הסליל הכפול של ה DNA הנמצא באנטראקציה עם
 
-
NF-Kb P50: הכיפוף הסלילי בקו מודגש, ה DNA "מתכופף" לכיוון הדומיינים הממוקמים בסמוך
 
-
ל major groove בצד ימין של ה DNA.
 
</p>
</p>
- 
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
 +
הדיאגרמה שלפניכם, מתארת באופן סכמטי את האינטראקציות בין <scene name='78/788816/Active_site_colors/2'>11 חומצות אמיניות</scene> (בסצנה כל חומצה אמינית מסומנת בצבע שונה)
 +
של החלבון p50 לבין 11 בסיסים DNA.
 +
<br><br>
 +
[[Image:מודל אתר פעיל.png]]
[[Image:מודל אתר פעיל.png]]
</p>
</p>
Line 105: Line 109:
<br>
<br>
הקומפלקס NF-kB, נמצא בתאים הומניים ונתגלה גם גם בתאי בעלי חיים ממחלקות שונות כמו: נבוביים כמו אלמוגים והידרה, ספוגיים, חרקים כמו תאי עשים, ייתוש וזבוב הפרות ועוד.
הקומפלקס NF-kB, נמצא בתאים הומניים ונתגלה גם גם בתאי בעלי חיים ממחלקות שונות כמו: נבוביים כמו אלמוגים והידרה, ספוגיים, חרקים כמו תאי עשים, ייתוש וזבוב הפרות ועוד.
-
ריצוף הגנום של בעלי חיים אלה מאפשר השוואה במבנה החלבון בבעלי החיים השונים, ולהעריך את השינויים האבולוציוניים בחלבון ה NFKN.
+
ריצוף הגנום של בעלי חיים אלה, מאפשר להשוות את מבנה החלבון בבעלי החיים השונים. השוואה זו גילתה שקיימים שינויים אבולוציוניים בחלבון NF-kB.
-
<br>
+
וכן נמצא שקיימים <scene name='78/788816/Evolutionary_conservation/3'>אתרים שמורים אבולוציוניים</scene> לאורך כל סוגי המחלקות של בעלי החיים, האתרים השמורים מסומנים בצבע סגול כהה ואילו אתרים לא שמורים מסומנים בצבע כחול (ניתן להיעזר בתמונה המצורפת עם מדדי השמירה האבולוציונית בצבעים השונים), האתר השמור ביותר הוא אתר הקישור של החלבון NF-kB עם הDNA (אתר RDH).
-
וכן נמצא שקיימים <scene name='78/788816/Evolutionary_conservation/1'>אתרים שמורים אבולוציוניים</scene> לאורך כל סוגי המחלקות של בעלי החיים, האתרים השמורים מסומנים בצבע סגול כהה ואילו אתרים לא שמורים מסומנים בצבע כחול (ניתן להיעזר בתמונה המצורפת עם מדדי השמירה האבולוציונית בצבעים השונים), האתר השמור ביותר הוא אתר הקישור של החלבון NF-kB עם הDNA (אתר RDH).
+
Line 116: Line 119:
</p>
</p>
<br><br><br>
<br><br><br>
- 
- 
- 
==<center>''' NFkB מסלול מעבר אותות של '''</center>==
==<center>''' NFkB מסלול מעבר אותות של '''</center>==
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
מעבר אותות בתא הוא תהליך שבו מומר סוג אחד של מולקולת אות לסוג/ים אחרים.
+
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/life_sci/%D7%AA%D7%A7%D7%A9%D7%95%D7%A8%D7%AA-%D7%AA%D7%90%D7%99%D7%AA-%E2%80%93-%D7%A9%D7%9C%D7%91-%D7%90%D7%97%D7%A8%D7%99-%D7%A9%D7%9C%D7%91 מעבר אותות תאיים] הוא הדרך שבה מומר סוג אחד של אות (מולקולה כימית) בסוג אחר של אות בתא.
 +
פעמים רבות סיגנלים חוץ תאיים נקשרים לאתרים ייחודים בממברנה ומאתחלים תהליך מעבר אותות בתא.
<br>
<br>
תהליך מעבר האותות כולל סדרת תגובות ביוכימיות, מהירות, המתווכות באמצעות אנזימים והפעלת שליחים שניוניים.
תהליך מעבר האותות כולל סדרת תגובות ביוכימיות, מהירות, המתווכות באמצעות אנזימים והפעלת שליחים שניוניים.
Line 129: Line 130:
מסלול מעבר אותות בתא מאפשר בקרה
מסלול מעבר אותות בתא מאפשר בקרה
בשלבים השונים של המסלול.
בשלבים השונים של המסלול.
-
שפעול החלבון NF-kB
 
-
כפקטור שיעתוק בתא באמצעות מסלול בקרת אותות בציטופלסמה ובגרעין:
 
<br>
<br>
 +
משום היות החלבון פקטור שיעתוק של גנים רבים, המשופעל על ידי גירויים מגוונים בסביבה החיצונית של התא, לצורך שיפעולו
 +
מתקיימים בתא מעגלי בקרה רבים המבוססים על [https://davidson.weizmann.ac.il/online/maagarmada/med_and_physiol/%D7%94%D7%A4%D7%A2%D7%9C%D7%AA-%D7%94%D7%AA%D7%92%D7%95%D7%91%D7%94-%D7%94%D7%97%D7%99%D7%A1%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%AA-%D7%A2%D7%9C-%D7%99%D7%93%D7%99-%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%98%D7%A0%D7%99-tlr הולכת אותות תאיים].
 +
<br>
 +
שפעול החלבון NF-kB
 +
כפקטור שיעתוק בתא, נעשה באמצעות מסלולי בקרת אותות המתקיימים הן בציטופלסמה והן בגרעין:
 +
<br><br>
 +
-
א. בציטופלסמה
+
'''א. בציטופלסמה'''
<br>
<br>
 +
 +
חלבוני NF-kB
 +
נמצאים בציטופלזמה, קשורים למולקולת חלבון מקבוצת
 +
IkB's , '''IkB's''' הם מעכבים של NF-kB.
 +
היחידות החלבוניות הבונות את ה NFkB
היחידות החלבוניות הבונות את ה NFkB
הן מולקולות גדולות (p105, p100 וכו').
הן מולקולות גדולות (p105, p100 וכו').
-
בעקבות סיגנלים תאיים, מתרחש תהליך שיפעול, אשר במהלכו אנזים מסוג קינאז IKK
+
 
-
מבצע פוספורילציה (זירחון) לתת היחידות החלבוניות,
+
 
-
אשר מוביל לחיתוך מולקולת חלבון הגדולות למולקולות קטנות יותר. המולקולות הקטנות הן אלה שיכולות להכנס לגרעין התא
+
בציטופלסמה, המצב הלא פעיל של NF-kB מושג הן בגלל אורך יחידות החלבון והן בגלל
 +
קישור החלבונים לחלבון מעכב NF-kB.
 +
<br>
 +
בעקבות רצף אותות (סיגנלים) תאיים, מתרחש תהליך שיפעול, אשר במהלכו אנזים מסוג קינאז IKK
 +
.מבצע פוספורילציה (זירחון) ליחידות החלבון.
 +
תהליך זה מוביל לחיתוך החלבון המעכב ולחיתוך מולקולות החלבון הגדולות למולקולות קטנות יותר.
 +
<br>
 +
החלבון שהתנתק מסומן ועובר פירוק [https://www.youtube.com/watch?v=dMiEfYV_Bwk בפרוטאוזום] והחלבון הערוך ("הבוגר") הבנוי ממולקולות קטנות יותר, יכול להיכנס לגרעין התא.
 +
 
 +
(כך למשל, מ
 +
p105
 +
נוצרת מולקולה p50).
<br><br>
<br><br>
 +
'''ב. בגרעין
 +
'''<br>
 +
p50, חלבון מונומר המהווה תת יחידה של
 +
NF-kB.
 +
תת יחידה זו נקשרת ל DNA
 +
יחד עם תת יחידת חלבון נוספת שנקראת RelA.
 +
שתי תת היחידות הקשורות ל DNA
 +
יוצרות מבנה הטרודימר .
 +
<br>
 +
משום שרק החלבון <scene name='78/788816/P50/9'>p50</scene>
 +
גובש, לא ניתן לראות בערך זה את שתי תת היחידות אלא רק את p50
 +
קשור ל DNA פעמיים.
 +
כך, לא ניתן לראות גם את קשרי המימן הנוצרים בין שני חלבונים אלה.
 +
<br>
 +
תת יחידות החלבון במצב ההומודימרי אינן יכולות להוות גורם שיעתוק, כאשר כל אחת בנפרד קשורה ל DNA.
 +
<br>
 +
p50 בלבד הקשור לאתר הפרומוטור עשוי להיות גורם מעקב שיעתוק.
 +
<br>
 +
בקרת שיעתוק בגרעין יכולה להיות:
 +
<br>
 +
על ידי קישור חלבון אחד, הומודימר, לאתר הפרומוטור, או לניתוק ההטרודימר הקשור. <br>
 +
בקרת שיעתוק מרכיבי החלבון NF-kB
 +
ו/או שיעתוק כל אחד מחלבוני הבקרה או האנזימים הקשורים בשיפעול NF-kB:
 +
<br>
 +
NF-kB, IKB's, ו IKK's
-
חלבוני NF-kB
 
-
נמצאים בציטוזול שבציטופלזמה קשורים למולקולות חלבון מקבוצת
 
-
IkB's , '''IkB's''' מהווים מעכבים של NF-kB.
 
-
 
-
בסביבה החיצונית. משום היותו פקטור תיעתוק של גנים רבים, המשופעל על ידי גירויים מגוונים (סיגנלים- אותות חוץ תאיים), מתקיימים בו מעגלי בקרה רבים המבוססים על הולכת אותות תאים, בקרה ציטופלסמטית (בציטופלזמה) ובקרת שיעתוק (בגרעין התא) לשפעול NF-kB בעצמו, להפיכתו לפעיל על מנת שיוכל לחדור מהציטופלזמה לגרעין התא .
 
-
בכל מסלולי האיתות בתא המובילים להשראת NF-kB , קיימת פעילות האנזים IKB קינאז ('''IKK''') המבצע פוספורילציה של IKB (המעכב) כך גורם לניתוקו מהדימר שאליו מחובר לNF-kB ובהמשך מוביל אותו לדגרדציה (פירוק).
 
<br>
<br>
-
רגולציה נוספת של פעילות NF-kB מתבצעת על ידי שינויים שלאחר התיעתוק של מרכיבי החלבון NF-kB:
 
-
NF-kB, IKB's, ו IKK's, ובתהליכים רב שלביים בציטופלסמה.
 
</p>
</p>
Line 158: Line 197:
</p>
</p>
<br>
<br>
- 
<p dir='rtl'>
<p dir='rtl'>
-
==<center>''' דף התלמיד '''</center>==
+
==<center>''' לחקר הסרטן NF-kB הקשר בין '''</center>==
</p>
</p>
- 
- 
-
== מקורות מידע ==
 
- 
-
1. ;Müller CW, Rey FA, Sodeoka M, Verdine GL, Harrison SC (January 1995). "Structure of the NF-kappa B p50 homodimer bound to DNA". Nature.
 
-
2. https://www.creative-diagnostics.com/The-NF-kB-Signaling-Pathway.htm
+
<p dir='rtl'>
 +
<br>
 +
בקרה תקינה (רגוליציה) של מסלולי שפעול NF-kB
 +
חיונית מאוד לביטוי, להתפתחות ולתפקוד תקין של תאים רבים.
 +
הפרעה בתהליכי בקרה של מסלולים אלה נצפית במחלות התפתחותיות רבות ובמחלות אחרות שהבולטת שבהן היא מחלת הסרטן.
 +
<br>
 +
מחלת הסרטן עשויה להופיע בעקבות גורמים רבים בהם שינויים בסביבה החוץ תאית הגורמים לתגובה דלקתית בתאים וכן, מוטציות [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%95%D7%A0%D7%A7%D7%95%D7%92%D7%9F אונקוגניות].
 +
<br>
 +
תפקיד חלבון ה NF-kB
 +
בהתפתחות התהליך הסרטני בתאים משך את תשומת הלב המחקרית.
 +
<br>
-
3. The NF-kappaB family of transcription factors and its regulation.
+
התפתחות התאים הסרטניים בהקשר לפעילות NFkB
 +
בתאים מתבטאת בארבע מנגנונים עיקריים:
 +
<br>
-
4. The complexity of NF-κB signaling in inflammation and cancer
+
1. עידוד פרוליפרציה של תאים (חלוקת תאים)
 +
ו/או מניעת תהליכי תמותת תאים (תהליכים אפופטוטיים)
 +
<br>
 +
2. עידוד [https://www.hayadan.org.il/starve-cancer-110812 אנגיוגנזה] - הווצרות כלי דם המובילים חומרי הזנה וחמצן לאזור
 +
הגידול הסרטני.
 +
<br>
 +
3. עידוד גרורות (מטסטזיס), של תאי אפיתל ברמות שונות:
 +
תאי האפיתל מאבדים את יכולת ההדבקות שלהם (אדהזיה) ורוכשים בכך תכונות של תאים נודדים.
 +
<br>
-
<scene name='78/788816/Active_site_brown/1'>אתר הפעיל חום</scene>
+
4. שינויים בתהליכים מטבוליים של התאים הסרטניים
 +
מנגנון משוב חיובי שגורם לקליטה מוגברת של גלוקוז, שמורה על קצב גבוה של תהליכי גליקוליזה המשפעלים מסלולי NFkB
 +
ושינויים הגורמים לתאי מערכת החיסון לא לטפל בתאים הסרטניים.
 +
<br><br>
-
<scene name='78/788816/Active_site_brown/2'>אתר פעיל חום בלי דנ"א</scene>
+
אחד מגורמי השעתוק המווסתים את פעילות NF-kB
 +
היא נוכחות חלבון [https://davidson.weizmann.ac.il/online/askexpert/life_sci/%D7%9E%D7%94-%D7%94%D7%9E%D7%99%D7%95%D7%97%D7%93-%D7%91%D7%92%D7%9F-p53-%D7%A9%D7%94%D7%95%D7%A4%D7%9A-%D7%90%D7%95%D7%AA%D7%95-%D7%9B%D7%94-%D7%9E%D7%A8%D7%9B%D7%96%D7%99-%D7%91%D7%A1%D7%A8%D7%98%D7%9F-%D7%93%D7%95%D7%A8%D7%99 P53].
-
<scene name='78/788816/Active_site_colors/1'>אתר הפעיל וחומוצות אמיניות בצבעים</scene>
 
-
<scene name='78/788816/Secondary_structure/1'>מבנה שניוני שרשראות אלפא ושרשראות שית</scene>
+
</p>
 +
<p dir='rtl'>
 +
==<center>''' דף התלמיד '''</center>==
 +
<br>
 +
[[Media:דף_עבודה_NFKB.pdf]]
 +
</p>
-
<scene name='78/788816/N-c_terminal/1'>קצוות N-C טרמינרל</scene>
 
-
<scene name='78/788816/Hidrofobi/1'>הידרופובי והידרופילי</scene>
+
== מקורות מידע ==
-
<scene name='78/788816/T_factor/1'>גורמי שעתוק</scene>
+
1. ;Müller CW, Rey FA, Sodeoka M, Verdine GL, Harrison SC (January 1995). "Structure of the NF-kappa B p50 homodimer bound to DNA". Nature.
 +
 +
2. https://www.creative-diagnostics.com/The-NF-kB-Signaling-Pathway.htm
 +
3. The NF-kappaB family of transcription factors and its regulation.
-
 
+
4. The complexity of NF-κB signaling in inflammation and cancer
-
<scene name='78/788816/P65_and_p50/1'>פקטור שעתוק עם שתי השרשראות</scene>
+

Current revision

גורם שעתוק NF-kB

PDB ID 1svc

Drag the structure with the mouse to rotate

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Dvora Bachar, Dafna Azoulay

Retrieved from "http://52.214.119.220/wiki/index.php/NF-kB_%28hebrew%29"
Personal tools