Proteins: primary and secondary structure (Czech)

From Proteopedia

(Difference between revisions)

Current revision

Primarní struktura

Na vidíte krátký úsek polypeptidového řetězce, na kterém si ukážeme základní vlastnosti primární struktury proteinu. Atomy tvořící hlavní řetězec jsou v cik-cak uspořádání, jak vyplývá geometrie jejich vazebných orbitalů. Postranní řetězce aminokyselin (takzvané R skupiny) vyčnívají to prostoru po stranách hlavního řetězce.
Podívejme se nyní na mezi dvěma aminokyselinami. Kvůli počtu elektronů ve vazebných orbitalech, peptidová vazba vykazuje některé vlastnosti dvojné vazby, která brání volné rotaci atomů na obou stranách této vazby. To znamená, že šest atomů v označených na modelu, jsou spoutané v planární konformaci. Přesvědčte se o tom na .
Hlavní řetězec je složen ze stále se opakující sekvence atomů: , , . Kvůli rotaci neumožněné na peptidové dvojné vazbě, polypeptidový řetězec můžeme pozorovat jako řetězec obdélníků. Každý z těchto může volně rotovat ve vztahu k ostatním.

Sekundární struktura - Ve většině proteinů se nachází dva typy sekundární struktury.

– spirálovitá struktura s výškou závitu 0,56 nm s . Nyní . Kostra polypeptidového řetězce tvoří spirálu na vnitřním okraji struktury a postranní řetězce jednotlivých aminokyselin vyčnívají ven do prostoru. Nyní skryjeme postranní řetězce pro přehlednější zobrazení a . Takzvaný zvýrazňuje spirálovitou strukturu hlavního řetězce, zatímco ukazuje uspořádání postranních řetězců. Alfa-helix je struktura zpevněná mnoha . Každá skupina tvořící peptidovou vazbu tvoří spirály.
Primární struktura určuje strukturu sekundární neboli sekundární struktura je určená sekvencí aminokyselin. Nyní se podíváme na a .

- Polypeptidový řetězec je v tomto případě uspořádaný cik-cak.

Skryjeme a pro lepší porozuměníPolypeptidový řetězec má rovné směrované úseky oddělené beta ohyby. Nyní znovu zvýrazníme a mezi sousedními rovnými úseky hrající i v této struktuře významnou stabilizační roli. Nakonec se podíváme na beta struktury.

References

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Jana Nedvědová

Retrieved from "http://52.214.119.220/wiki/index.php/Proteins:_primary_and_secondary_structure_%28Czech%29"

@@ Line 1: / Line 1: @@
 [[es:Proteins: primary and secondary structure (Spanish)]]
+[[cs:Proteins: primary and secondary structure (Czech)]]
 <StructureSection load='' size='500' side='right' caption='' scene='60/603296/Primaria/2'>
 <big>
@@ Line 9: / Line 10: @@
 *'''Sekundární struktura''' - Ve většině proteinů se nachází dva typy sekundární struktury.
 :*<scene name='60/603296/Secundaria/4'>Alfa-helix</scene> – spirálovitá struktura s výškou závitu 0,56 nm s  <scene name='60/603296/Secundaria/5'>kruhovým vnitřním průřezem</scene>. Nyní  <scene name='60/603296/Secundaria/7'>skryjeme vodíky</scene>. Kostra polypeptidového řetězce tvoří spirálu na vnitřním okraji struktury a postranní řetězce jednotlivých aminokyselin vyčnívají ven do prostoru. Nyní skryjeme postranní řetězce pro přehlednější zobrazení <scene name='60/603296/Secundaria/8'>od konce</scene>  a  <scene name='60/603296/Secundaria/10'>ze strany</scene>. Takzvaný <scene name='60/603296/Secundaria/11'>ribbon model</scene> zvýrazňuje spirálovitou strukturu hlavního řetězce, zatímco  <scene name='60/603296/Secundaria/13'>atomární model</scene> ukazuje uspořádání postranních řetězců. ''Alfa-helix'' je struktura zpevněná mnoha <scene name='60/603296/Secundaria/14'>vodíkovými můstky</scene>. Každá skupina tvořící peptidovou vazbu tvoří <scene name='60/603296/Secundaria/15'>vodíkové můstky se skupinami v okolních smyčkách</scene> spirály.
-:*Primary structure specifies secondary structure, i.e., is the amino acid sequence which determines that a polypeptide chain folds resulting a alfa helix or other secondary structure. Let's consider the effects of <scene name='60/603296/Secundaria/20'>electrical charged residues</scene> of either sign and the <scene name='60/603296/Secundaria/21'>side chains size</scene>.
+:*Primární struktura určuje strukturu sekundární neboli sekundární struktura je určená sekvencí aminokyselin. Nyní se podíváme na <scene name='60/603296/Secundaria/20'>nabité postranního řetězce</scene> a <scene name='60/603296/Secundaria/21'>jejich velikost</scene>.
-:*'''<scene name='60/603296/Secundaria2/1'>Beta sheet</scene>'''.- Polypeptide chain is folded in zigzag arrangement. Let's <scene name='60/603296/Secundaria2/2'>hide hydrogen atoms</scene> and <scene name='60/603296/Secundaria2/3'>side chains</scene> for a better understanding. Notice that a polypeptide chain can have several linear fragments separated by curvatures called ''beta turns''. Now let's recover <scene name='60/603296/Secundaria2/4'>side chains</scene> and highlight the <scene name='60/603296/Secundaria2/5'>hydrogen bonds</scene> between different linear sections of the chain. This hydrogen bonds give stability to the structure. Let's look now the polypeptide chain represented by a <scene name='60/603296/Secundaria2/6'>ribbon model</scene>.
+:*'''<scene name='60/603296/Secundaria2/1'>Beta struktura skládaného listu</scene>''' - Polypeptidový řetězec je v tomto případě uspořádaný cik-cak.
+:*Skryjeme <scene name='60/603296/Secundaria2/2'>vodíkové atomy</scene> a <scene name='60/603296/Secundaria2/3'>postranní řetězce</scene> pro lepší porozuměníPolypeptidový řetězec má rovné směrované úseky oddělené beta ohyby. Nyní znovu zvýrazníme  <scene name='60/603296/Secundaria2/4'>postranní řetězce</scene> a <scene name='60/603296/Secundaria2/5'>vodíkové vazby</scene> mezi sousedními rovnými úseky hrající i v této struktuře významnou stabilizační roli. Nakonec se podíváme na <scene name='60/603296/Secundaria2/6'>ribbon model</scene> beta struktury.
 </StructureSection>
 == References ==
 <references/>

Proteins: primary and secondary structure (Czech)

From Proteopedia

Current revision

References

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Views

Personal tools

Navigation

Search

Toolbox

In other languages