This old version of Proteopedia is provided for student assignments while the new version is undergoing repairs. Content and edits done in this old version of Proteopedia after March 1, 2026 will eventually be lost when it is retired in about June of 2026.
Apply for new accounts at the new Proteopedia. Your logins will work in both the old and new versions.
User:Veronika Pelekhov/Sandbox 1
From Proteopedia
< User:Veronika Pelekhov(Difference between revisions)
(New page: ==Your Heading Here (maybe something like 'Structure')== <StructureSection load='1stp' size='340' side='right' caption='Caption for this structure' scene=''> This is a default text for you...) |
|||
| (105 intermediate revisions not shown.) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
| - | == | + | |
| - | <StructureSection load=' | + | == S<sub>N</sub>1 התמרה נוקלאופילית - מנגנון == |
| - | + | ''' [[en:SN1 reaction]] | |
| - | + | <StructureSection load='' size='340' side='right' caption='' scene='88/887008/Side_view/2'> | |
| - | = | + | <p dir='rtl'> |
| - | == | + | == התמרה נוקלאופילית == |
| + | </p> | ||
| + | <p dir='rtl'> | ||
| + | התמרה נוקלאופילית היא אחת התגובות הנפוצות בכימיה אורגנית. בהתמרה נוקלאופילית אחת הקבוצות הכימיות, הקשורות למולקולה המגיבה, מוחלפת בקבוצה כימית אחרת. | ||
| + | המולקולה המגיבה נקראת '''סובסטרט'''. הקבוצה הכימית החדשה, אשר נקשרת לסובסטרט, נקראת '''נוקלאופיל''' והיא נוטה למסור אלקטרונים. | ||
| + | הקבוצה הכימית, אשר מוחלפת, נקראת '''הקבוצה העוזבת'''. הקבוצה העוזבת תהיה בדרך כלל בעלת אופי אלקטרושלילי. | ||
| + | התמרה נוקלאופילית יכולה להתרחש בשני מנגנוני תגובה עיקריים - S<sub>N</sub>1 ו-S<sub>N</sub>2 | ||
| + | .</p> | ||
| - | == | + | <p dir='rtl'> |
| + | == S<sub>N</sub>1 מנגנון == | ||
| + | </p> | ||
| - | = | + | <p dir='rtl'> |
| + | מנגנון S<sub>N</sub>1 מתרחש בשני שלבים. בהתחלה מפורק הקשר בין מולקולת הסובסטרט לקבוצה העוזבת ונוצר קרבוקטיון (יון טעון חיובית). בשלב השני מתרחשת היקשרות הנוקלאופיל לקרבוקטיון ומתקבל תוצר סופי. באופן כללי, התמרה נוקלאופילית S<sub>N</sub>1 יכולה להתרחש כאשר יכול להיווצר קרבוקטיון יציב. אם לא, התגובה תתרחש במנגנון S<sub>N</sub>2. | ||
| + | השלב הראשון, בו נוצר הקרבוקטיון, הוא השלב האיטי ולכן הוא שלב קובע קצב התגובה. כמו שניתן לראות, קצב התגובה לא מושפע מריכוזו ואופיו של נוקלאופיל, אשר מעורב רק בשלב השני. | ||
| + | כלומר, שלב קובע קצב התגובה מושפע רק ממגיב אחד ולכן קצב התגובה יהיה מסדר ראשון. | ||
| + | ספרה 1 מצביעה על כך שמדובר במנגנון חד-מולקולרי. | ||
| + | הקרבוקטיון, המתקבל בשלב הראשון, בעל גיאומטריה מישורית. עובדה זו מאפשרת לנוקלאופיל לתקוף מכל אחד מצידיו של הקרבוקטיון. | ||
| + | אי לכך, כאשר הסובסטרט הוא [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%9B%D7%99%D7%A8%D7%90%D7%9C%D7%99%D7%95%D7%AA כיראלי], יוכלו להתקבל שני [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A0%D7%A0%D7%98%D7%99%D7%95%D7%9E%D7%A8 אננטיומרים] | ||
| + | .</p> | ||
| - | This is a sample scene created with SAT to <scene name="/12/3456/Sample/1">color</scene> by Group, and another to make <scene name="/12/3456/Sample/2">a transparent representation</scene> of the protein. You can make your own scenes on SAT starting from scratch or loading and editing one of these sample scenes. | ||
| - | </ | + | [[Image:SN1 reaction mechanism.png|350px]] |
| + | |||
| + | == S<sub>N</sub>1 {{RTL | וטרט-בוטנול במנגנון}} Cl<sup>-</sup> {{RTL |התמרה נוקלאופילית של}} == | ||
| + | |||
| + | <p dir='rtl'> | ||
| + | דוגמה לתגובה המתרחשת במנגנון S<sub>N</sub>1 היא החלפת קבוצת הידרוקסיל במולקולת טרט- בוטנול (טרט-בוטיל אלכוהול) על ידי יון הכלור. | ||
| + | <jmol><jmolLink><script>anim mode once; frame range 1 10; delay 0.5; frame play</script><text>התגובה מתחילה</text></jmolLink></jmol> עם יציאת יון הידרוקסיד מהמולקולה (הקבוצה העוזבת), במקרה הנתון ממולקולת טרט-בוטיל אלכוהול. כך נוצר קרבוקטיון עם גיאומטריה מישורית. <jmol><jmolLink><script>anim mode once; frame range 11 20; delay 0.5; frame play</script><text>בשלב השני</text></jmolLink></jmol> יון ההלוגן (הנוקלאופיל) נקשר לקרבוקטיון ונוצר הלואלקאן (אלקיל-הליד) נייטרלי . | ||
| + | .</p> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | [[Image:reaction_scheme_sn1.jpg|500px]] | ||
| + | |||
| + | <jmol> | ||
| + | <jmolButton><script>frame 1</script><text>First</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>frame prev</script><text>Previous</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>anim mode once; frame 1; delay 0.5; anim on</script><text>Play</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>frame next</script><text>Next</text></jmolButton> | ||
| + | </jmol> | ||
| + | |||
| + | <jmol> | ||
| + | <jmolButton><script>frame all</script><text>All frames</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>animation mode palindrome 0.5 0.2; anim on</script><text>Loop backwards and forward</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>if(_animating);anim off;else;frame play;endif</script><text>Toggle animation</text></jmolButton> | ||
| + | </jmol> | ||
| + | <jmol> | ||
| + | <jmolButton><script>spacefill 90; dots on; wireframe 30;</script><text>translucent atoms</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>spacefill on; dots off;</script><text>spacefilling atoms</text></jmolButton> | ||
| + | <jmolButton><script>spacefill 90; dots off; wireframe 30;</script><text>backbone</text></jmolButton> | ||
| + | </jmol> | ||
| + | ===See also=== | ||
| + | [[SN2_reaction|S<sub>N</sub>2 reaction: Substitution of chloride and methanol]] | ||
== References == | == References == | ||
| + | This demo was adapted from http://www.chemieunterricht-interaktiv.de/en/animations/sn1_substutition/sn1_substitution_3d.html by Dr. V. Pietzner, part of the ChiLe project | ||
<references/> | <references/> | ||
| + | </StructureSection> | ||
| + | [[Category: BioMolViz]] | ||
| + | [[Category: Chemical Reactions]] | ||
Current revision
SN1 התמרה נוקלאופילית - מנגנון
| |||||||||||
