Cytochrome C (arabic)

From Proteopedia

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (22:53, 1 May 2022) (edit) (undo)
 
(15 intermediate revisions not shown.)
Line 44: Line 44:
<br>
<br>
صورة 2
صورة 2
-
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית -
+
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.
-
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,
+
-
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת
+
-
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.
+
]]
]]
<br>
<br>
Line 73: Line 70:
صورة 4
صورة 4
</p>
</p>
-
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]
+
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]
<br>
<br>
<br>
<br>
Line 83: Line 80:
صورة 5
صورة 5
</p>
</p>
-
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]
+
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]
<br>
<br>
<br>
<br>
Line 94: Line 91:
صورة 6
صورة 6
</p>
</p>
-
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין.
+
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي البروتين سيتوكروم سي في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.
-
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד.
+
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي.
 +
 
]]
]]
<br>
<br>
Line 102: Line 100:
صورة 7
صورة 7
</p>
</p>
-
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]
+
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|
 +
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )
 +
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]
<br>
<br>
<br>
<br>
Line 119: Line 119:
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==
-
 
+
<p dir='rtl'>
-
 
+
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.
 +
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".
 +
<br>
 +
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات.
 +
<br>
 +
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.
 +
<br>
 +
<br>
 +
صورة 9
 +
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]
 +
</p>
 +
<br>
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==
-
 
+
<p dir='rtl'>
-
 
+
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم.
 +
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين
 +
</p>
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==
-
 
+
<p dir='rtl'>
-
 
+
[https://proteopedia.org/wiki/images/a/a8/Homework_%28arabic%29.pdf ورقة عمل للطالب]
 +
<br>
 +
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]
 +
</p>
 +
<br>
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==
 +
<br>
 +
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]
 +
<br>
 +
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]
 +
<br>
 +
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]
 +
<br>
 +
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]
 +
<br>
 +
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]
 +
<br>
 +
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]
 +
<br>
 +
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]
 +
<br>
 +
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]
 +
<br>
 +
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]
 +
<br>
 +
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]

Current revision

سيتوكروم سي البشري

.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية يرتبط هذا البروتين بمجموعة هيم وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)

سيتوكروم سي البشري (PDB code 1j3s)

Drag the structure with the mouse to rotate

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Fatima M Hameed

Personal tools