User:María Sánchez Morán/TFGParte4
From Proteopedia
(Difference between revisions)
(New page: {| <div style=;position:relative;margin-left:auto;margin-right:auto;padding:10px;border:1px solid #ededed;background-color:#FFFAFA;box-shadow:0px 0px 10px #ededed;"> <div id="punto53"></...) |
|||
Line 3: | Line 3: | ||
<div id="punto53"></div> | <div id="punto53"></div> | ||
- | <p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.3. Propuesta </p> | + | <p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.3. Propuesta del grupo de Ishikita </p> |
+ | |||
+ | Este grupo utiliza una aproximación híbrida mecánica cuántica/mecánica molecular (por sus siglas en inglés, QM/MM) y simulaciones de dinámica molecular (por sus siglas en inglés, MD) para estudiar la liberación de protones, la formación de dioxígeno y los cambios estructurales del clúster Mn4CaO5 cuando se produce su oxidación en un entorno proteico. [20] | ||
+ | |||
+ | La propuesta consiste en un mecanismo (esquematizado en Fig. 5) en el que las fuentes de átomos de oxígeno para la formación del enlace O=O son el O4 del OEC, que se encuentra formando el enlace µ<sub>2</sub>-oxo, y una de las moléculas sustrato de agua, concretamente la situada en W1. [18, 20] Puede resumirse en los siguientes puntos: | ||
+ | |||
+ | *El centro de formación de oxígeno está ligado a una cadena transportadora de electrones, a una cadena transportadora de protones y a una cadena de consumo de moléculas de agua. | ||
+ | |||
+ | *En el estado S<sub>0</sub> O4 se encuentra unido a un protón. En la primera etapa, se produce la desprotonación del enlace µ-OH y la oxidación de Mn3(III) a Mn3(IV). | ||
+ | |||
+ | *En la transición de S<sub>1</sub> a S<sub>2</sub> se produce una segunda oxidación en los átomos de manganeso, en este caso de Mn4(III) a Mn4(IV). | ||
+ | |||
+ | *En el estado S<sub>2</sub> el protón de la molécula de agua situada en W1 migra hasta D1-Asp61 como consecuencia de la oxidación de Mn4, formándose un enlace de hidrógeno de baja energía: (HO<sub>W1</sub><sup>-</sup>···H<sup>+</sup>···<sup>-</sup>OOC<sub>D1-Asp61</sub>) |