2cf4 (Italian)

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La proteolisi cellulare usa grande peptidasi oligomeriche che giocano ruoli chiave nella regolazione di molti processi cellulari. La peptidase TET1, cobalto-attivata, dal Archaea ipertermofilo ''Pyrococcus horikoshii'' (''Ph''TET1) si assembla come un tetraedro di 12 sub-unità e come una particella ottaedrale di 24 sub-unità. Ambo le strutture quaternarie furono risolte combinando cristallografia ai raggi X e dati di crio-microscopia elettronica. L'organizzazione interna delle particelle di ''Ph''TET1 rivela sistemi estremamente stesso-compartiti fatti di reti di canali di accesso, estese da grande camere catalitiche. I due edifici mostrano una attività di aminopeptidase, e le loro organizzazioni indicano meccanismi di navigazione di sostrato diverso da quelli descritti negli altri grandi complessi di peptidase. Comparato col tetraedro, l'ottaedro forma una struttura cavo e più allargata, rappresentando un tipo nuovo di complesso di peptidase gigante. ''Ph''TET1 assembla in due strutture quaternarie diverse a causa di contatti quasi-equivalenti che prima sono stati identificati solamente in capsids di virus.
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La proteolisi cellulare usa grande peptidasi oligomeriche che giocano ruoli chiave nella regolazione di molti processi cellulari. La peptidase TET1, cobalto-attivata, dal Archaea ipertermofilo ''Pyrococcus horikoshii'' (''Ph''TET1) si assembla come un tetraedro di 12 sub-unità e come una particella ottaedrale di 24 sub-unità. Ambo le strutture quaternarie furono risolte combinando cristallografia ai raggi X e dati di crio-microscopia elettronica. L'organizzazione interna delle particelle di ''Ph''TET1 rivela sistemi estremamente stesso-compartiti fatti di reti di canali di accesso, estese da grande camere catalitiche. I due edifici mostrano una attività di aminopeptidase, e le loro organizzazioni indicano meccanismi di navigazione di sostrato diversi da quelli descritti negli altri grandi complessi di peptidase. Comparato col tetraedro, l'ottaedro forma una struttura cavo e più allargata, rappresentando un tipo nuovo di complesso di peptidase gigante. ''Ph''TET1 assembla in due strutture quaternarie diverse a causa di contatti quasi-equivalenti che prima sono stati identificati solamente in capsidi di virus.
Riassunto tradotto di MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.
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Revision as of 21:26, 23 November 2009

PDB ID 2cf4

Drag the structure with the mouse to rotate
2cf4, resolution 3.08Å ()
Ligands:
Non-Standard Residues:
Resources: FirstGlance, OCA, RCSB, PDBsum
Coordinates: save as pdb, mmCIF, xml




PYROCOCCUS HORIKOSHII TET1 PEPTIDASE PUO ASSEMBLARE IN UN TETRAEDRO O UN GRANDE OTTAEDRO

La proteolisi cellulare usa grande peptidasi oligomeriche che giocano ruoli chiave nella regolazione di molti processi cellulari. La peptidase TET1, cobalto-attivata, dal Archaea ipertermofilo Pyrococcus horikoshii (PhTET1) si assembla come un tetraedro di 12 sub-unità e come una particella ottaedrale di 24 sub-unità. Ambo le strutture quaternarie furono risolte combinando cristallografia ai raggi X e dati di crio-microscopia elettronica. L'organizzazione interna delle particelle di PhTET1 rivela sistemi estremamente stesso-compartiti fatti di reti di canali di accesso, estese da grande camere catalitiche. I due edifici mostrano una attività di aminopeptidase, e le loro organizzazioni indicano meccanismi di navigazione di sostrato diversi da quelli descritti negli altri grandi complessi di peptidase. Comparato col tetraedro, l'ottaedro forma una struttura cavo e più allargata, rappresentando un tipo nuovo di complesso di peptidase gigante. PhTET1 assembla in due strutture quaternarie diverse a causa di contatti quasi-equivalenti che prima sono stati identificati solamente in capsidi di virus.

Riassunto tradotto di MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

A proposito di questa Struttura

2CF4 è una struttura a 1 catena di sequenza di Pyrococcus horikoshii. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su OCA.

Riferimento

  • Schoehn G, Vellieux FM, Asuncion Dura M, Receveur-Brechot V, Fabry CM, Ruigrok RW, Ebel C, Roussel A, Franzetti B. An archaeal peptidase assembles into two different quaternary structures: A tetrahedron and a giant octahedron. J Biol Chem. 2006 Nov 24;281(47):36327-37. Epub 2006 Sep 14. PMID:16973604 doi:10.1074/jbc.M604417200

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