Sandbox MosheRiven
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| Line 19: | Line 19: | ||
'''3. מבנה החלבון:''' | '''3. מבנה החלבון:''' | ||
| - | אובלבומין הוא חלבון המורכב מ - 385 <scene name='Sandbox_MosheRiven/Amino_acids/1'>חומצות אמינו</scene> ומסה של 45 קילו דלתון. לחלבון ארבעה דומיינים | + | אובלבומין הוא חלבון המורכב מ - 385 <scene name='Sandbox_MosheRiven/Amino_acids/1'>חומצות אמינו</scene> ומסה של 45 קילו דלתון. לחלבון ארבעה דומיינים [[image:4 domains of ovalbumin1.jpg|center|thumb|450px|ארבעת הדומיינים של האובלבומין. דומיין D קצר יותר ומורכב מעיקר ממבני אלפא הליקס]] כאשר דומיינים A, B ו – C מכילים גם מיבני אלפא-הליקס וגם משטחי בטא. דומיין D הוא קטן יותר ומכיל בעיקר אלפא-הליקס, ונקרא הלופ החשוף של אובלבומין. |
לאחר שלב התרגום אובלבומין עובר שינויים ברצף שלו וכן נוספות לו תוספות כימיות המכונות באופן כללי מודיפיקציות פוסט-תירגומיות: 1) לאחר הסרת המתיונין הראשוני מתווספת קבוצת אצטיל (CH4) לקצה ה-N טרמינלי החדש. 2) פוספורילציה של שני שיירי סרין (69 ו-345). 3) אתר גליקוזילציה על חומצה אספרטית 293 שמקבל את השייר הסוכרי N-acetyl-D-glucosamine. | לאחר שלב התרגום אובלבומין עובר שינויים ברצף שלו וכן נוספות לו תוספות כימיות המכונות באופן כללי מודיפיקציות פוסט-תירגומיות: 1) לאחר הסרת המתיונין הראשוני מתווספת קבוצת אצטיל (CH4) לקצה ה-N טרמינלי החדש. 2) פוספורילציה של שני שיירי סרין (69 ו-345). 3) אתר גליקוזילציה על חומצה אספרטית 293 שמקבל את השייר הסוכרי N-acetyl-D-glucosamine. | ||
האובלבומין מכיל שישה ציסטאינים, ששנים מהם (74 ו-121) יוצרים גשר די-סולפידי. | האובלבומין מכיל שישה ציסטאינים, ששנים מהם (74 ו-121) יוצרים גשר די-סולפידי. | ||
| Line 31: | Line 31: | ||
הומולוגיית מבנה עם חלבונים אחרים יכולה לרמז על תיפקוד אפשרי לאובלבומין. לאובלבומין הומולוגיית מבנה של 30% לסרפינים. | הומולוגיית מבנה עם חלבונים אחרים יכולה לרמז על תיפקוד אפשרי לאובלבומין. לאובלבומין הומולוגיית מבנה של 30% לסרפינים. | ||
| - | [[image:antitripsin vs ovalbomin and rcl.jpg| | + | [[image:antitripsin vs ovalbomin and rcl.jpg|center|thumb|450px|דמיון מבני מהותי בין אובלבומין לאנטיטריפסין]] |
| Line 39: | Line 39: | ||
בעוד שבסרפינים אחרים הלופ המרכזי יכול להכנס בין גדילי הבטא של דומיין A באותו חלבון או בחלבונים אחרים (לדוגמא החלבון אנטי-טריפסין ממשפחת הסרפינים, שמאמץ מספר מצבים בהתאם למיקום הלופ המרכזי), הלופ המרכזי באובלבומין אינו עובר את השינוי המבני הזה. | בעוד שבסרפינים אחרים הלופ המרכזי יכול להכנס בין גדילי הבטא של דומיין A באותו חלבון או בחלבונים אחרים (לדוגמא החלבון אנטי-טריפסין ממשפחת הסרפינים, שמאמץ מספר מצבים בהתאם למיקום הלופ המרכזי), הלופ המרכזי באובלבומין אינו עובר את השינוי המבני הזה. | ||
| - | [[image:Several formations of serpins and RCL position.jpg| | + | [[image:Several formations of serpins and RCL position.jpg|center|450px|]] |
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| - | + | ||
| + | מתוך ידיעת מיבני הסרפינים היכולים להחדיר את הלופ המרכזי בין גדילי הבטא, נמצא כי לחומצה אמינית הראשונה שחודרת תפקיד מכריע בייצוב במבנה החדש. באובלבומין חומצה אמינית זו היא ארגינין. קיימת הסברה כי בשל היותה חומצה אמינית טעונה, היא הופכת את הלופ לפחות יציב מבחינה תרמו דינמית, ולכן אינו יכול להיות מוחדר בין גדילי הבטא. | ||
| + | ---- | ||
'''סיכום :''' | '''סיכום :''' | ||
הימצאותו בטבע בכמויות גדולות מחד, וחוסר הידע לגבי פעילותו מאידך מציבים את האובלבומין כחלבון מאתגר מבחינה מחקרית. העובדה שיש לו הומולוגיה משמעותית למשפחת הסרפינים, ובכל זאת אינו נושא את תכונת עיכוב פרוטאזות של בני המשפחה וכן היכולת שלו לשאת מולקולות סוכר ומים הובילה את החוקרים להנחה כי החלבון מספק נוטריינטים ואנרגיה לעובר הגדל. | הימצאותו בטבע בכמויות גדולות מחד, וחוסר הידע לגבי פעילותו מאידך מציבים את האובלבומין כחלבון מאתגר מבחינה מחקרית. העובדה שיש לו הומולוגיה משמעותית למשפחת הסרפינים, ובכל זאת אינו נושא את תכונת עיכוב פרוטאזות של בני המשפחה וכן היכולת שלו לשאת מולקולות סוכר ומים הובילה את החוקרים להנחה כי החלבון מספק נוטריינטים ואנרגיה לעובר הגדל. | ||
| + | ---- | ||
6. '''רפרנס''': | 6. '''רפרנס''': | ||
Revision as of 20:50, 27 February 2013
האובלבומין
| |||||||||||
