RuBisCO (Hebrew)
From Proteopedia
| Line 8: | Line 8: | ||
אנזים זה מעורב בקיבוע הפחמן, בתהליך זה פחמן דו-חמצני אטמוספרי מומר על ידי צמחים למולקולה עשירה באנרגיה, כמו [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%9C%D7%95%D7%A7%D7%95%D7%96 גלוקוז]. מבחינה כימית, הרוביסקו עושה קטליזה של הקרבוקסילציה של [http://www.rcsb.org/pdb/ligand/ligandsummary.do?hetId=RUB&sid=1RCX ריבולוז-1,5-ביפוספט] (RuBP). | אנזים זה מעורב בקיבוע הפחמן, בתהליך זה פחמן דו-חמצני אטמוספרי מומר על ידי צמחים למולקולה עשירה באנרגיה, כמו [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%9C%D7%95%D7%A7%D7%95%D7%96 גלוקוז]. מבחינה כימית, הרוביסקו עושה קטליזה של הקרבוקסילציה של [http://www.rcsb.org/pdb/ligand/ligandsummary.do?hetId=RUB&sid=1RCX ריבולוז-1,5-ביפוספט] (RuBP). | ||
<br> | <br> | ||
| - | + | ||
</p> | </p> | ||
| Line 15: | Line 15: | ||
בצמחים, אצות, ציאנובקטריה ופרוטאובקטריות (פוטוטרופיות וכמוטרופיות) הרוביסקו בדרך כלל בנוי משני תתי-יחידות, הנקראים Large-chain (L, 55,000 Da בערך) ו-Small chain (S, 13,000 Da בערך). | בצמחים, אצות, ציאנובקטריה ופרוטאובקטריות (פוטוטרופיות וכמוטרופיות) הרוביסקו בדרך כלל בנוי משני תתי-יחידות, הנקראים Large-chain (L, 55,000 Da בערך) ו-Small chain (S, 13,000 Da בערך). | ||
| - | אתרי הקישור לסובסטרט (ריבולוז 1,5-ביפוספט) ממוקמים בשרשרת הגדולה (Large chain) היוצרת דימרים, שבהם חומצות אמינו מכל שרשרת גדולה תורמות לאתר הקישור. שמונה שרשראות גדולות (=4 דימרים) ושמונה שרשראות קטנות (Small chain) יוצרים קומפלקס גדול של בערך 540,000 Da. בכמה פרוטאובקטריות ודינופלגלות נמצאו אנזימים בעלי תת-יחידות גדולות בלבד. | + | אתרי הקישור לסובסטרט (ריבולוז 1,5-ביפוספט) ממוקמים בשרשרת הגדולה (Large chain) היוצרת דימרים, שבהם חומצות אמינו מכל שרשרת גדולה תורמות לאתר הקישור. שמונה שרשראות גדולות (=4 דימרים) ושמונה שרשראות קטנות (Small chain) יוצרים <scene name='46/463261/Rubisco_spacefill_holoenzyme/1'>קומפלקס</scene> (בכחול- שרשראות גדולות, בצהוב- שרשראות קטנות) גדול של בערך 540,000 Da. |
| + | <br> | ||
| + | בכמה פרוטאובקטריות ודינופלגלות נמצאו אנזימים בעלי תת-יחידות גדולות בלבד. | ||
<br> | <br> | ||
זהו המבנה של השרשרת הגדולה של חלבון הרוביסקו, אשר בנוייה מ-477 <scene name='58/586572/Aa/1'>חומצות אמינו</scene>. | זהו המבנה של השרשרת הגדולה של חלבון הרוביסקו, אשר בנוייה מ-477 <scene name='58/586572/Aa/1'>חומצות אמינו</scene>. | ||
| Line 22: | Line 24: | ||
<br> | <br> | ||
הרוביסקו מוביל לשתי ריאקציות: קרבוקסילציה של ריבולוז-1,5-ביפוספט(האירוע העיקרי בפיקסציה של הפחמן הדן-חמצני) וגם לפרגמנטציה החמצנית של הסובסטרט פנטוז בתהליך הפוטורספירציה. שתי הריאקציות מתרחשות בו-זמנית ומתחרות על אותו אתר פעיל. | הרוביסקו מוביל לשתי ריאקציות: קרבוקסילציה של ריבולוז-1,5-ביפוספט(האירוע העיקרי בפיקסציה של הפחמן הדן-חמצני) וגם לפרגמנטציה החמצנית של הסובסטרט פנטוז בתהליך הפוטורספירציה. שתי הריאקציות מתרחשות בו-זמנית ומתחרות על אותו אתר פעיל. | ||
| + | |||
</p> | </p> | ||
| - | == Disease == | ||
| - | |||
| - | == Relevance == | ||
== Structural highlights == | == Structural highlights == | ||
| Line 36: | Line 36: | ||
http://www.uniprot.org/uniprot/P00875 | http://www.uniprot.org/uniprot/P00875 | ||
| + | <br> | ||
http://www.ruppweb.org/Xray/101index.html | http://www.ruppweb.org/Xray/101index.html | ||
| + | <br> | ||
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=1RCX | http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=1RCX | ||
| + | <br> | ||
http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A4%D7%95%D7%98%D7%95%D7%A1%D7%99%D7%A0%D7%AA%D7%96%D7%94 | http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A4%D7%95%D7%98%D7%95%D7%A1%D7%99%D7%A0%D7%AA%D7%96%D7%94 | ||
| + | <br> | ||
Revision as of 10:16, 27 May 2014
רוביסקו
|
רוביסקו (ריבולוז-1,5-ביספוספט קרבוקסילאז/אוקסיגנאז) הוא האנזים הנפוץ ביותר בכדור הארץ. זהו האנזים המזרז את השלב הראשון במעגל קלווין כחלק מתהליך הפוטוסינתזה.
אנזים זה מעורב בקיבוע הפחמן, בתהליך זה פחמן דו-חמצני אטמוספרי מומר על ידי צמחים למולקולה עשירה באנרגיה, כמו גלוקוז. מבחינה כימית, הרוביסקו עושה קטליזה של הקרבוקסילציה של ריבולוז-1,5-ביפוספט (RuBP).
מבנה
בצמחים, אצות, ציאנובקטריה ופרוטאובקטריות (פוטוטרופיות וכמוטרופיות) הרוביסקו בדרך כלל בנוי משני תתי-יחידות, הנקראים Large-chain (L, 55,000 Da בערך) ו-Small chain (S, 13,000 Da בערך).
אתרי הקישור לסובסטרט (ריבולוז 1,5-ביפוספט) ממוקמים בשרשרת הגדולה (Large chain) היוצרת דימרים, שבהם חומצות אמינו מכל שרשרת גדולה תורמות לאתר הקישור. שמונה שרשראות גדולות (=4 דימרים) ושמונה שרשראות קטנות (Small chain) יוצרים (בכחול- שרשראות גדולות, בצהוב- שרשראות קטנות) גדול של בערך 540,000 Da.
בכמה פרוטאובקטריות ודינופלגלות נמצאו אנזימים בעלי תת-יחידות גדולות בלבד.
זהו המבנה של השרשרת הגדולה של חלבון הרוביסקו, אשר בנוייה מ-477 .
החלבון בנוי רבים.
מבנה הרוביסקו הזה נלקח מתרד. המבנה כולל בתוכו גם את הסובסטרט הטבעי שלו - ריבולוז 1,5-ביפוספט (RuBP). המבנה של שניהם התגלה ע"י X-ray crystalography ברזולוציות של 2.1 A ושל 2.4 A בהתאמה.
הרוביסקו מוביל לשתי ריאקציות: קרבוקסילציה של ריבולוז-1,5-ביפוספט(האירוע העיקרי בפיקסציה של הפחמן הדן-חמצני) וגם לפרגמנטציה החמצנית של הסובסטרט פנטוז בתהליך הפוטורספירציה. שתי הריאקציות מתרחשות בו-זמנית ומתחרות על אותו אתר פעיל.
Structural highlights
This is a sample scene created with SAT to by Group, and another to make of the protein. You can make your own scenes on SAT starting from scratch or loading and editing one of these sample scenes.
References
http://www.uniprot.org/uniprot/P00875
http://www.ruppweb.org/Xray/101index.html
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=1RCX
http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A4%D7%95%D7%98%D7%95%D7%A1%D7%99%D7%A0%D7%AA%D7%96%D7%94
Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)
Saar Graidi, Daniel Yash, Shany Doron, Alexander Berchansky, Michal Harel
