Taq DNA polymerase (Hebrew)
From Proteopedia
| Line 1: | Line 1: | ||
| - | =<center>'' דנ"א פולימראז | + | =<center>''' טאק דנ"א פולימראז '''</center>= |
<p dir='rtl'> | <p dir='rtl'> | ||
| - | + | טאק פולימראז הוא דנ"א פולימראז שעמיד בחום, הנקרא על שם החיידק התרמופילי Thermus aquaticus. האנזים בודד לראשונה מהחיידק Thermus aquaticus על ידי Thomas D. Brock ב-1965. ב-PCR, שיטה המשמשת להגברת מקטעים קטנים של דנ"א, משתמשים לעיתים קרובות בטאק פולימראז. | |
| + | </p> | ||
| - | <br /> | ||
| - | <br /> | ||
| - | + | =<center>''' מבנה הטאק פולימראז'''</center>= | |
| - | < | + | <Structure load='1taq' size='500' frame='true' align='left' caption=' מבנה תלת מימדי של טאק דנ"א פולימראז' scene='Insert optional scene name here' /> |
| + | <p dir='rtl'> | ||
| + | טאק דנ"א פולימראז מורכב מ-832 <scene name='70/701971/832_amino_acid/1'>חומצות אמינו</scene> (כל חומצה אמינית צבועה בצבע אחר) ומשקלו המולקולארי 94 קילו דלתון. הוא מורכב משרשרת פוליפפטידית אחת (המסומנת באיור בסגול). | ||
| - | Thermus aquaticus הוא חיידק שחי במעיינות חמים | + | </p> |
| - | + | <br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /> | |
| + | ==<center>'''PCR-השימוש באנזים ב ''' </center>== | ||
| + | |||
| + | <p dir='rtl'> | ||
| + | Thermus aquaticus הוא חיידק שחי במעיינות חמים וטאק פולימראז זוהה כאנזים שעמיד לתנאי הדנטורציה של החלבון (טמפרטורות גבוהות) שנדרשים במהלך ה-PCR. לכן הוא החליף את הדנ"א פולימראז מהאי-קולי שהשתמשו בו במקור ב-PCR. הטמפרטורה המיטבית (אופטימאלית) עבור פעילות של טאק היא 72-75 מעלות צלזיוס, עם זמן מחצית חיים של מעל שעתיים ב-92.5 מעלות צלזיוס ויכול לשכפל 1000 בסיסים מצומדים של גדיל דנ"א בפחות מ-10 דקות ב-72 מעלות צלזיוס. טאק יציב בטמפרטורה של 95 מעלות צלזיוס, הטמפרטורה שנדרשת עבור דנטורציה של סליל דנ"א (כלומר, ניתוק הקשרים בין 2 גדילי הדנ"א ויצירת דנ"א חד גדילי). טאק פולימראז הוא כלי בעל ערך בתחום הביולוגיה המולקולארית. משתמשים בו באופן נרחב ב-PCR בגלל העמידות שלו לחום ולכן צריך להוסיפו רק פעם אחת בתחילת תהליך ה-PCR. | ||
| + | </p> | ||
<br /> | <br /> | ||
| - | <Structure load='1taq' size='500' frame='true' align='left' caption='מבנה תלת מימדי של אלבומין' scene='Insert optional scene name here' /> | ||
<br /> | <br /> | ||
| - | + | . | |
You may include any references to papers as in: the use of JSmol in Proteopedia <ref>DOI 10.1002/ijch.201300024</ref> or to the article describing Jmol <ref>PMID:21638687</ref> to the rescue. | You may include any references to papers as in: the use of JSmol in Proteopedia <ref>DOI 10.1002/ijch.201300024</ref> or to the article describing Jmol <ref>PMID:21638687</ref> to the rescue. | ||
| Line 26: | Line 31: | ||
<scene name='70/701971/3_functional_domains/2'>המחולקות ל-3 דומיינים פונקציונליים</scene> | <scene name='70/701971/3_functional_domains/2'>המחולקות ל-3 דומיינים פונקציונליים</scene> | ||
<scene name='70/701971/Binding_to_dna/5'>איזור קושר דנ"א</scene> | <scene name='70/701971/Binding_to_dna/5'>איזור קושר דנ"א</scene> | ||
| - | <scene name='70/701971/Zn_binding/ | + | <scene name='70/701971/Zn_binding/6'>אזור קושר אבץ</scene> |
== Function == | == Function == | ||
Revision as of 20:16, 31 May 2015
Contents |
טאק דנ"א פולימראז
טאק פולימראז הוא דנ"א פולימראז שעמיד בחום, הנקרא על שם החיידק התרמופילי Thermus aquaticus. האנזים בודד לראשונה מהחיידק Thermus aquaticus על ידי Thomas D. Brock ב-1965. ב-PCR, שיטה המשמשת להגברת מקטעים קטנים של דנ"א, משתמשים לעיתים קרובות בטאק פולימראז.
מבנה הטאק פולימראז
|
טאק דנ"א פולימראז מורכב מ-832 (כל חומצה אמינית צבועה בצבע אחר) ומשקלו המולקולארי 94 קילו דלתון. הוא מורכב משרשרת פוליפפטידית אחת (המסומנת באיור בסגול).
PCR-השימוש באנזים ב
Thermus aquaticus הוא חיידק שחי במעיינות חמים וטאק פולימראז זוהה כאנזים שעמיד לתנאי הדנטורציה של החלבון (טמפרטורות גבוהות) שנדרשים במהלך ה-PCR. לכן הוא החליף את הדנ"א פולימראז מהאי-קולי שהשתמשו בו במקור ב-PCR. הטמפרטורה המיטבית (אופטימאלית) עבור פעילות של טאק היא 72-75 מעלות צלזיוס, עם זמן מחצית חיים של מעל שעתיים ב-92.5 מעלות צלזיוס ויכול לשכפל 1000 בסיסים מצומדים של גדיל דנ"א בפחות מ-10 דקות ב-72 מעלות צלזיוס. טאק יציב בטמפרטורה של 95 מעלות צלזיוס, הטמפרטורה שנדרשת עבור דנטורציה של סליל דנ"א (כלומר, ניתוק הקשרים בין 2 גדילי הדנ"א ויצירת דנ"א חד גדילי). טאק פולימראז הוא כלי בעל ערך בתחום הביולוגיה המולקולארית. משתמשים בו באופן נרחב ב-PCR בגלל העמידות שלו לחום ולכן צריך להוסיפו רק פעם אחת בתחילת תהליך ה-PCR.
.
You may include any references to papers as in: the use of JSmol in Proteopedia [1] or to the article describing Jmol [2] to the rescue.
Function
Disease
Relevance
Structural highlights
This is a sample scene created with SAT to by Group, and another to make of the protein. You can make your own scenes on SAT starting from scratch or loading and editing one of these sample scenes.
References
- ↑ Hanson, R. M., Prilusky, J., Renjian, Z., Nakane, T. and Sussman, J. L. (2013), JSmol and the Next-Generation Web-Based Representation of 3D Molecular Structure as Applied to Proteopedia. Isr. J. Chem., 53:207-216. doi:http://dx.doi.org/10.1002/ijch.201300024
- ↑ Herraez A. Biomolecules in the computer: Jmol to the rescue. Biochem Mol Biol Educ. 2006 Jul;34(4):255-61. doi: 10.1002/bmb.2006.494034042644. PMID:21638687 doi:10.1002/bmb.2006.494034042644
