Viewing guide (Spanish)

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==Uso de la consola==
==Uso de la consola==
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The console is a way to pass any command to Jmol. As a casual user of Jmol, you only need to know a handful of commands not available through the menu. If you become a frequent user of Jmol, you might stop using the menu and type commands instead once you are familiar with them. To open the console, use the menu item "Console". Try it.
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La consola sirve para transmitir a Jmol cualquier instrucción. Si eres un usuario ocasional sólo necesitas conocer unas pocas instrucciones que no estén disponibles a través del menú. Si llegas a ser un usuario frecuente de Jmol quizá dejes de usar el menú y escribas las instrucciones, una vez te hayas familiarizado con ellas. Para abrir la consola pulsa en la entrada "Consola" disponible en el menú. Pruébalo.
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*Finding a residue: If you want to find a specific residue in a structure and you know the residue number, say residue 72, type "center 72" in the console. You can also select it by typing "select 72", and then change how it is represented in the 3D figure by using the menu.
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*Localización de un residuo: Si conoces el número del residuo en la estructura, por ejemplo el residuo 72, escribe <code>center 72</code> en la consola; el modelo se moverá para situar ese residuo en el centro. También puedes seleccionarlo escribiendo <code>select 72</code> y después cambiar su aspecto en el modelo 3D usando opciones del menú.
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*Selecting multiple parts of the molecule: When using the menu to select, each new selection command cancels the old one. Using the console, you can type something like "selected selected or 33" to add residue 33 to your selection. You can also select multiple parts of the structure in a single command like "select (42, 67, 82) and sidechain and _C", which would select all carbon atoms in the side chain of residues 42, 67 and 82. You can learn common selection command in this [http://cbm.msoe.edu/includes/modules/jmolTutorial/jmolSelect.html tutorial]. The complete set of selection commands is explained in the Jmol manual.
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*Selección de varias partes de la molécula: Cuando uses el menú para seleccionar, cada nueva selección cancela la anterior. Usando la consola es posible combinar selecciones; por ejemplo, si escribes <code>selected selected or 33</code> añadirás los átomos del residuo 33 a la selección anterior. También es posible seleccionar varias partes de una sola vez con una instrucción como <code>select (42, 67, 82) and sidechain and _C</code>, que selecconará todos los átomos de carbono de las cadenas laterales de los residuos 42, 67 y 82. Puedes aprender algunas instrucciones de selección frecuentes en esta [http://cbm.msoe.edu/includes/modules/jmolTutorial/jmolSelect.html guía] (en inglés). La colección completa de instrucciones de selección se explica en el [{{ScriptingDoc}}#atomexpressions manual de Jmol].
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*Showing hydrogen bond: Select the entire structure or parts you are interested in (e.g. "select backbone and helix"), then type "hbonds calculate" in the console. This will calculate possible hydrogen bonds and display them.
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*Mostrar enlaces de hidrógeno: Selecciona la estructura completa o las partes que te interesen (por ej., <code>select backbone and helix</code>) y luego escribe <code>hbonds calculate</code> en la consola. Esto localizará posibles enlaces de hidrógeno y los mostrará.
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*Increasing the size of labels shown when hovering: When giving a presentation and projecting a page, the "hover labels" are sometimes too small and too complicated to be appreciated by the viewers. A command like
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*Aumentar el tamaño de las etiquetas que se muestran al colocar el puntero sobre un átomo: A menudo, principalmente en presentaciones con proyector, las etiquetas son demasiado pequeñas o complejas para que el público las observe bien. Puede resolverse con una instrucción como esta: <code>hover "%n%R %a"; font hover 30</code>
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<nowiki>hover "%n%R %a"; font hover 30</nowiki>
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will help.
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</StructureSection>
</StructureSection>
¡Ya estás preparado para explorar el fascinante mundo de las proteínas presentado en Proteopedia!
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Revision as of 14:19, 19 October 2020

Guía para la visualización

Se presenta aquí una breve guía para leer un artículo de Proteopedia y ver las figuras tridimensionales integradas. Como estructura de ejemplo usaremos la lisozima unida a un . En la , la proteína se muestra en azul (más exactamente deepSkyBlue, azul celeste oscuro) en forma de trazo de esqueleto siguiendo los carbonos alfa, y el carbohidrato en formato de varillas, coloreado según el esquema de colores CPK. La lisozima fue la primera estructura resuelta de una enzima.

Drag the structure with the mouse to rotate

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Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Angel Herraez

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