User:María Sánchez Morán/TFGParte4
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<p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.3. Propuesta del grupo de Ishikita </p> | <p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.3. Propuesta del grupo de Ishikita </p> | ||
- | Este grupo utiliza una aproximación híbrida mecánica cuántica/mecánica molecular (por sus siglas en inglés, QM/MM) y simulaciones de dinámica molecular (por sus siglas en inglés, MD) para estudiar la liberación de protones, la formación de dioxígeno y los cambios estructurales del clúster | + | Este grupo utiliza una aproximación híbrida mecánica cuántica/mecánica molecular (por sus siglas en inglés, QM/MM) y simulaciones de dinámica molecular (por sus siglas en inglés, MD) para estudiar la liberación de protones, la formación de dioxígeno y los cambios estructurales del clúster Mn<sub>4</sub>CaO<sub>5</sub> cuando se produce su oxidación en un entorno proteico. [20] |
La propuesta consiste en un mecanismo (esquematizado en Fig. 5) en el que las fuentes de átomos de oxígeno para la formación del enlace O=O son el O4 del OEC, que se encuentra formando el enlace µ<sub>2</sub>-oxo, y una de las moléculas sustrato de agua, concretamente la situada en W1. [18, 20] Puede resumirse en los siguientes puntos: | La propuesta consiste en un mecanismo (esquematizado en Fig. 5) en el que las fuentes de átomos de oxígeno para la formación del enlace O=O son el O4 del OEC, que se encuentra formando el enlace µ<sub>2</sub>-oxo, y una de las moléculas sustrato de agua, concretamente la situada en W1. [18, 20] Puede resumirse en los siguientes puntos: | ||
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*En el estado S<sub>2</sub> el protón de la molécula de agua situada en W1 migra hasta D1-Asp61 como consecuencia de la oxidación de Mn4, formándose un enlace de hidrógeno de baja energía: (HO<sub>W1</sub><sup>-</sup>···H<sup>+</sup>···<sup>-</sup>OOC<sub>D1-Asp61</sub>) | *En el estado S<sub>2</sub> el protón de la molécula de agua situada en W1 migra hasta D1-Asp61 como consecuencia de la oxidación de Mn4, formándose un enlace de hidrógeno de baja energía: (HO<sub>W1</sub><sup>-</sup>···H<sup>+</sup>···<sup>-</sup>OOC<sub>D1-Asp61</sub>) | ||
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+ | *En la transición de S<sub>2</sub> a S<sub>3</sub>, se produce una reacción redox donde disminuye el potencial de reducción de W1: O<sub>W1</sub>H<sup>-</sup> → O·<sub>W1</sub><sup>-</sup> y está facilitada por una cadena transportadora de protones acoplada a una cadena transportadora de electrones. El protón que se libera es aceptado por D1-Asp61. | ||
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