User:María Sánchez Morán/TFGParte3
From Proteopedia
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<p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.2. Propuesta del grupo de Barber</p> | <p style="font-size:16px;border-bottom:1px solid #ac9de3;background-color:#eae8f5;padding:3px;text-indent:5px;">5.2. Propuesta del grupo de Barber</p> | ||
+ | <StructureSection load='3rec' size='350' side='right' caption='Escherichia coli reca protein-bound DNA (PDB entry [[3rec]])' scene=''> | ||
Para desarrollar esta propuesta, el grupo de Barber se ha basado en las similitudes estructurales (Fig. 3) existentes entre el OEC y la enzima carbono monóxido deshidrogenasa que contiene hierro y níquel (Fe-Ni CODH). Esta enzima consiste en un cubano Fe<sub>3</sub>NiS<sub>4</sub> unido a un cuarto Fe vía puente de sulfuro, formando el clúster Fe<sub>4</sub>NiS<sub>5</sub>, que tiene un mecanismo conocido basado en un ataque nucleófilo catalizado por una base. [17] En el caso del OEC, se propone la formación del enlace O-O como consecuencia de un ataque nucleófilo de un grupo hidroxilo, que se encuentra ligado al átomo de calcio, a un átomo de oxígeno con carácter electrófilo, unido a un manganeso en alto estado de oxidación. [17, 18] A continuación se presentan las características más importantes de este mecanismo, que también quedan reflejadas en la Fig. 4 | Para desarrollar esta propuesta, el grupo de Barber se ha basado en las similitudes estructurales (Fig. 3) existentes entre el OEC y la enzima carbono monóxido deshidrogenasa que contiene hierro y níquel (Fe-Ni CODH). Esta enzima consiste en un cubano Fe<sub>3</sub>NiS<sub>4</sub> unido a un cuarto Fe vía puente de sulfuro, formando el clúster Fe<sub>4</sub>NiS<sub>5</sub>, que tiene un mecanismo conocido basado en un ataque nucleófilo catalizado por una base. [17] En el caso del OEC, se propone la formación del enlace O-O como consecuencia de un ataque nucleófilo de un grupo hidroxilo, que se encuentra ligado al átomo de calcio, a un átomo de oxígeno con carácter electrófilo, unido a un manganeso en alto estado de oxidación. [17, 18] A continuación se presentan las características más importantes de este mecanismo, que también quedan reflejadas en la Fig. 4 | ||
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En esta propuesta se sugiere la presencia de Mn(V) en el estado S<sub>4</sub>, que no ha sido identificado experimentalmente en el OEC, aunque cabría la posibilidad de que se deba al corto periodo de vida del S<sub>4</sub>. [17] En contra tiene también los cálculos teóricos realizados posteriormente, que han demostrado la inviabilidad de este mecanismo por las altas barreras energéticas que presenta. [18,19] | En esta propuesta se sugiere la presencia de Mn(V) en el estado S<sub>4</sub>, que no ha sido identificado experimentalmente en el OEC, aunque cabría la posibilidad de que se deba al corto periodo de vida del S<sub>4</sub>. [17] En contra tiene también los cálculos teóricos realizados posteriormente, que han demostrado la inviabilidad de este mecanismo por las altas barreras energéticas que presenta. [18,19] | ||
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<p style="font-size:13px;text-align:justify;padding:10px;width:98%;background-color:#ecf7ef;border:1px solid #F3D4DF;"> | <p style="font-size:13px;text-align:justify;padding:10px;width:98%;background-color:#ecf7ef;border:1px solid #F3D4DF;"> |
Revision as of 11:02, 3 February 2022
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