BamHI (Hebrew)
From Proteopedia
(Difference between revisions)
| Line 25: | Line 25: | ||
בירוק), צורת האנזים כשאינו במצב קשירה כמשטח β מוקף | בירוק), צורת האנזים כשאינו במצב קשירה כמשטח β מוקף | ||
<scene name='90/900794/Alpha_helix/1'>סלילי α</scene> ( סלילי אלפא מוצגים בצבע ירוק בדימר אחד ובכחול בדימר השני). הדבר היוצא דופן והייחודי במולקולת האנזים הוא זה שהיא עוברת שינויים מבניים לא שגרתיים בעת קשירה ל DNA ובכך מבנה ה DNA נשמר תקין ולא עובר עיוות דבר שמסייע לקשירת האנזים. | <scene name='90/900794/Alpha_helix/1'>סלילי α</scene> ( סלילי אלפא מוצגים בצבע ירוק בדימר אחד ובכחול בדימר השני). הדבר היוצא דופן והייחודי במולקולת האנזים הוא זה שהיא עוברת שינויים מבניים לא שגרתיים בעת קשירה ל DNA ובכך מבנה ה DNA נשמר תקין ולא עובר עיוות דבר שמסייע לקשירת האנזים. | ||
| - | אפשר להתבונן <scene name='90/900794/Beta_sheet_and_alpha_helix/1'>במבנה שניוני של האנזים BamHI</scene> בו סלילי אלפא מוצגים בצבע ירוק ומשטחי בטא בצבע כחול | + | אפשר להתבונן <scene name='90/900794/Beta_sheet_and_alpha_helix/1'>במבנה שניוני של האנזים BamHI</scene> בו סלילי אלפא מוצגים בצבע ירוק ומשטחי בטא בצבע כחול. |
| + | </p> | ||
| + | <p dir='rtl'> | ||
[https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/543264/3803376/gr1.jpg באנזים BamHI] משטחי <scene name='90/900794/B_sheet/1'> ( β 3, β 4, β 5, β 6, β 7, β1) </scene>(משטחי בטא בצהוב וסלילי אלפא בוורוד) מוקפים ע"י סלילי α בקצה האחד של פיתול β, יש שלושה שיירים קטליטיים (Asp94, Glu111 ו-Glu113 ) שהם מהווים ביחד את <scene name='90/900794/Active_site/7'>האתר הפעיל</scene> של האנזים בסצנה רואים את ה DNA (באדום) נקשר לאתר הפעיל של האנזים בחומצות אמינו Asp94, Glu111 ו-Glu113 (מסומנות בירוק בדימר אחד ובכחול בדימר השני). שלושת חומצות האמינו האלו באנזים קושרות יון מגנזיום שפועל כקו פקטור. | [https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/543264/3803376/gr1.jpg באנזים BamHI] משטחי <scene name='90/900794/B_sheet/1'> ( β 3, β 4, β 5, β 6, β 7, β1) </scene>(משטחי בטא בצהוב וסלילי אלפא בוורוד) מוקפים ע"י סלילי α בקצה האחד של פיתול β, יש שלושה שיירים קטליטיים (Asp94, Glu111 ו-Glu113 ) שהם מהווים ביחד את <scene name='90/900794/Active_site/7'>האתר הפעיל</scene> של האנזים בסצנה רואים את ה DNA (באדום) נקשר לאתר הפעיל של האנזים בחומצות אמינו Asp94, Glu111 ו-Glu113 (מסומנות בירוק בדימר אחד ובכחול בדימר השני). שלושת חומצות האמינו האלו באנזים קושרות יון מגנזיום שפועל כקו פקטור. | ||
Revision as of 18:46, 5 February 2022
BamHI אנזים חיתוך
מבוא
BamHI הוא אנזים הגבלה השייך לקבוצה גדולה של אנזימי חיתוך שהם אנזימים מסוגלים לחתוך DNA באזורים מסוימים. אנזימי ההגבלה הינם אנדונוקלאזות (כלומר חותכים בתוך מולקולות DNA), בניגוד לקבוצת אנזימי חיתוך DNA אחרים הקרויים אקסונוקלאזות המעכלים מקטעי DNA לינארים מקצוותיהם. אנזימי הגבלה, כמו כל אנזים אחר, ייחודיים בפעולתם, כל אנזים נקשר לרצף ייחודי ב DNA שנקרא אתר ההגבלה, לאחר התקשרות האנזים לאתר הוא חותך את הסליל הכפול במקום ההיצמדות. הרצף באתר ההגבלה מורכב מ-4 עד 12 נוקלאוטידים. בטבלה 1 שלוש דוגמאות לאנזימי הגבלה מאורגניזמים שונים והרצף ב DNA שהם נקשרים אליו:
| |||||||||||
References
מיכאל, ד' וירדן, ע' (2008). הנדסה גנטית מעקרונות ושיטות למחקר ויישומים. רחובות: מכון ויצמן המחלקה להוראת המדעים, הוצאת משרד החינוך.
