Peptidyl-tRNA hydrolase 2, mitochondrial (Hebrew)
From Proteopedia
| Line 119: | Line 119: | ||
מטח - נחשון. (n.d.). התא – מבנה ותפקוד מ-DNA לחלבון [מצגת PowerPoint]. מתוך https://misgav.iscool.co.il/LinkClick.aspx?fileticket=f58X85a83ZU%3D&tabid=514&mid=14011&language=he-IL | מטח - נחשון. (n.d.). התא – מבנה ותפקוד מ-DNA לחלבון [מצגת PowerPoint]. מתוך https://misgav.iscool.co.il/LinkClick.aspx?fileticket=f58X85a83ZU%3D&tabid=514&mid=14011&language=he-IL | ||
| + | <scene name='10/1025411/The_moutauions/2'>TextToBeDisplayed</scene> | ||
</li> | </li> | ||
</ol> | </ol> | ||
</div> | </div> | ||
Revision as of 09:43, 5 March 2024
Contents |
רנ״א מוביל הידרולאז 2 מיטוכונדריאלי
|
תהליך תרגום
תהליך התרגום הוא תהליך ביולוגי חיוני המתרחש בכל תאי היצורים החיים ומשמש לייצור חלבונים. החלבונים מבצעים את רוב התהליכים בתאים חיים כולל תפקידים קטליטיים ,מעורבים ביצירת מבנה התא , העברת אותות ועוד.תהליך התרגום מתרחש על ידי הריבוזום שהינו קומפלקס גדול העשוי מחלבון ומרנ"א . הריבוזום נקשר למולקולות של רנ"א שליח (m-RNA) המורכבות מנוקלאוטידים ועל בסיסם הוא מייצר חלבונים, כל שלושה נוקלאוטידים (אבני הבניין של הרנ"א ) מרכבים קודון שמקודד לחומצת אמינו מסוימת . יצירת החלבון על סמך רצף הקודונים נעשית על ידי מולקולות רנ"א מוביל (t-RNA) שנקשרות לרנ"א שליח ונושאות את חומצת האמינו המתאימה .כל חומצת אמינו חדשה שמתווספת מייצרת קשר פפטידי עם חומצת האמינו הקודמת. באופן הזה נוצר רצף של חומצות אמינו אשר מהוות את החלבון השלם המתקפל לאחר מכן לצורתו התלת – ממדית הפעיל, הקוד מאפשר לתא ליצור חלבונים בעלי רצף קבוע וחזוי מראש עם מבנה ותפקיד . שלבי תהליך התרגום בתמונות הבאות (מימין לשמאל )מתוארת בניית שרשרת חומצות אמיניות קצרה באורך 5 חומצות אמיניות בלבד.
 |  |  |  |  |
החשיבות של בקרה בתהליך התרגום
למלמרות החשיבות הרבה של תהליך התרגום ליצירת חלבונים תקינים ופעילים ,לעיתים תהליך זה עלול להסתיים מוקדם מדי כתוצאה מכך זה יוביל ליצירת חלבונים לקויים לא פעילים. סיום מוקדם גורם להצטברות של חלבונים לקויים בתא וזה יכול להיות רעיל יכול לפגוע בתפקוד התאי , לכן קיימים מנגנוני בקרה שמטרתם לזהות ולהתמודד עם יצירת החלבונים הלקויים . אחד מהמנגנונים החשובים הוא פעילות האנזים רנ״א מוביל הידרולאז 2 (PTRH2 ) אשר משחרר את החלבון ממולקולת t-RNA תהליך המאפשר לתא להשמיד את החלבון הלקוי וכך התא מבטיח שרק חלבונים תקינים ופעילים משתתפים בתהליכים חיוניים בתא במקום להיות רעילים לתאים .
המבנה של החלבון
|
החלבון PTRH2
משקלו המולקולרי של החלבון PTRH2 הינו 19 קילו-דלטון .(KDa) החלבון מורכב מ179 חומצות אמינו. חלבון זה הינו (תת יחידה אחת מסומנת ב צבע כחול ותת יחידה שניה בצבע כחול בהיר). כל תת יחידה מורכבת משני חלקים (מתחמים) עיקרים : חלק ראשון הוא רצף סיגנל -רצף חומצות אמינו בתחילת החלבון משמש ככתובת להובלת החלבון למיטוכונדריה ששם הוא ממלא את תפקידו הביולוגי (החלק הזה אינו מוצג במבנה המוצג בערך זה), והחלק השני אחראי על ההידרוליזה הקטליטית המשמש לפעילות החלבון. המתחם הקטליטי (המוצג בערך – מחומצת אמינו 63 עד 179 בחלבון המלא) מעורב בתפקיד החיוני של החלבון ובהישרדות התא כמו כל חלבון, גם חלבון זה מאופיין בשלוש רמות מבנה: מבנה ראשוני שמתאר את רצף חומצות האמינו של החלבון, שמתייחס לקיפולים המקומיים של החלבון הכוללים סלילי אלפא (צבועים בזהב) וחמישה משטחי בטא (צבועים בכחול), המקטע 80-99 צבוע כחול-אפור הינו סליל האלפא הליקס הכי גדול במבנה והוא מעורב בקישור לחלבונים שונים קישור חלבונים דרך אזור זה יכול להשפיע על מגוון פונקציות תאיות ותהליכים כמו העברת אותות ,ותהליכים מטבוליים וויסות פעילות חלבונים שונים . עמדה 85 המכילה את חומצת האמינו גלוטמין היא חלק חשוב עם חומצת האמינו תראונין בעמדה 157, חומצת האמינו אספרטט בעמדה 145 ,וחומצת האמינו ליזין בעמדה 81 . רשת אינטראקציות זו מייצבת את החלבון ועוזרת לשמור על המיקום הנכון של סליל האלפא המרכזי בין סלילי האלפא ומשטחי הבטא, דבר החשוב לקיפולו ,שמירת המבנה התלת ממדי ופעילותו. חומצות האמינו גלוטמין בעמדה 85 , ליזין בעמדה 81 ותראונין בעמדה 157 הינם חלק מהאתר הפעיל . החומצה אמינו תירוזין בעמדה 94 (בצבע ירוק) נמצאת באינטראקציות עם עמדות סמוכות כולל קשרי מימן ואינטראקציות הידרופוביות שהם חשובות לקיפול החלבון ולפונקציה של החלבון .
מחלות ומוטציות בחלבון
IMNEPD היא מחלה נדירה הנגרמת על ידי מוטציות בגן PTRH2 משפיעה על מערכות הנוירולוגית ,האנדוקרינית והלבלב .המחלה קיימת באוכלוסיות שונות ברחבי העולם כולל קהילות ערביות. חומרת המחלה נעה בהתאם לסוג המוטציה בגן PTRH2 כאשר מאופיינת בספקטרום רחב של תסמינים כולל פיגור התפתחותי , בעיות שמיעה, אטקסיה (קשיים בשמירה על שיווי משקל)ובעיות בלבלב . מוכר מספר מוטציות בחלבון שמובילות למחלה כאשר כל מוטציה משפיעה באופן שונה על החלבון שבסוף מובילות למחלה כמו
- מוטציית החלפת חומצות אמינו בעמדה 85 במקום הגלוטמין (Q) לפרולין(P):
היא נחשבת מבין המוטציות הנפוצות ביותר בקרב הקהילות הערביות השכיחות שלה 56%, היא מובילה להפחתה ביציבות החלבון ובפעילותו הקטליטית של האנזים , כאשר עמדה 85 מאבדת את אינטראקציות בין חומצות אמינו אחרות עקב החלפתה בחומצה אמינו פרולין שאינה מסוגלת לקיים אותם קשרים כתוצאה מכך מופחתת יציבות ופעילות החלבון כאשר האינטראקציות אבדו ולא ניתן לתמוך במבנה ובתפקוד הנכון של החלבון .המוטציה הזו עלולה להוביל לפנוטיפ עדין יותר של המחלה בהשוואה למוטציות שונות.
- 43Kfs*11:
מוטציה שגורמת להזזת מסגרת הקריאה , נוצרת הזזה במסגרת הקריאה של הקודונים של הדנ"א ובכך מוביל לסיום מוקדם של תהליך התרגום , לאחר 11 חומצות אמינו . כתוצאה מכך נוצר חלבון מקוטע שאינו מלא ולא פונקציונלי.
- המוטציה Y94N:
מתארת החלפת חומצה אמינו מתירוזין (Y) לאספרגין (N)בעמדה 94 , לפי תיאור המבנה של החלבון העמדה נחשבת חלק מהאלפא הליקס הגדול 80-99 שמשומש כאתר קישור לחלבון, כתוצאה מכך תשפיע המוטציה באופן שלילי על האינטראקציות בין החלבון PTRH2 לחלבונים אחרים .
-
המוטציות W108 ו110E:
גורמות ליצירת חלבון PRTH2 מקוטע המוטציה W108 היא מוטציית סיום , והמוטציה 110E היא סינתזת החלבון ללא חלק מהמקטע ההידרוליזה הקטליטית של החלבון , שתי המוטציות משפיעות על יכולתו לבצע את הפונקציה שלו
חשוב לזכור שמוטציות באנשים שונים יכולה להיות שונות בהתבטאות המחלה ,התובנה שביטוי הפנוטיפ משתנה באופן משמעותי בגלל שהוא תלוי בגורמים גנטיים נוספים ,סביבתיים ואינטראקציות בין גנים לסביבה .
שאלות
מקורות
- Sharkia, R., Jain, S., Mahajnah, M., Habib, C., Azem, A., Al-Shareef, W., & Zalan, A. (2023). PTRH2 Gene Variants: Recent Review of the Phenotypic Features and Their Bioinformatics Analysis. Genes, 14(5), 1031. https://www.mdpi.com/2073-4425/14/5/1031
- מכון דוידסון. (2015, ספטמבר 7). איך נוצר תהליך התרגום. מכון דוידסון לחינוך מדעי. נלקח מ https://davidson.weizmann.ac.il/online/askexpert/life_sci/%D7%90%D7%99%D7%9A-%D7%A0%D7%95%D7%A6%D7%A8-%D7%AA%D7%94%D7%9C%D7%99%D7%9A-%D7%94%D7%AA%D7%A8%D7%92%D7%95%D7%9D
- מטח - נחשון. (n.d.). התא – מבנה ותפקוד מ-DNA לחלבון [מצגת PowerPoint]. מתוך https://misgav.iscool.co.il/LinkClick.aspx?fileticket=f58X85a83ZU%3D&tabid=514&mid=14011&language=he-IL
