Als erstes, einfaches Beispiel soll Maleinsäure untersucht werden. Maleinsäuremoleküle kristallisieren in flachen Schichten. Durch anklicken der grünen Links kann wahlweise nur , oder dann wieder der angezeigt werden.
Mit der Maus lässt sich die Abbildung bearbeiten:
- Molekül drehen: linke Maustaste anklicken
- Zoom: scroll wheel = Rädchen in der Mitte der Maus oder shift+linke Maustaste
- Verschieben: ctrl + rechte Maustaste
Suche nun Wasserstoffbrücken in diesem Kristall. Markiere dabei jede gefundene Brücke mit dem Distanzmessungs-Tool:
- Distanzen messen: Erstes Atom doppelklicken, zweites Atom doppelklicken
1.1 Gibt es von einer Molekülebene zur nächsten Wasserstoffbrücken?
1.2 Wie viele verschiedenartige Wasserstoffbrücken gibt es innerhalb einer Molekülebene?
1.3 Wie hält ein Maleinsäurekristall zusammen?
Übrigens: man kann auch Winkel und Torsionswinkel (Diederwinkel) messen:
- Winkel messen: erstes Atom doppelklicken, zweites Atom einfach anklicken, drittes Atom doppelklicken.
- Torsionswinkel (Diederwinkel) messen: erstes Atom doppelklicken, zweites und drittes Atom einfach anklicken, viertes Atom doppelklicken.
