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==This is a placeholder== This is a placeholder text to help you get started in placing a Jmol applet on your page. At any time, click "Show Preview" at the bottom of this page to see how it goes. Replace the PDB id (use lowercase!) after the STRUCTURE_ and after PDB= to load and display another structure. {{STRUCTURE_2j5k | PDB=2j5k | SCENE= }} {{Seed}} [[Image:2j5k.png|left|200px]] <!-- The line below this paragraph, containing "STRUCTURE_2j5k", creates the "Structure Box" on the page. You may change the PDB parameter (which sets the PDB file loaded into the applet) or the SCENE parameter (which sets the initial scene displayed when the page is loaded), or leave the SCENE parameter empty for the default display. --> ===STRUTTURA A 2 A DI RESOLUZIONE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DI ''HALOARCULA MARISMORTUI'' DI TIPO SELVATICO (SERIA DI DANNI PROVOCATI DALLA RADIAZIONE)=== La radiazione intensa del sincrotrone produce specifici danni strutturali e chimici a proteine cristalline a 100 K. I gruppi "carboxyl" di residui acidi (Glu, Asp) che perdono la loro definizione sono uno degli effetti notevoli osservati. Qui, i danni devuti agli ragi X sui residui acidi nella malate dehydrogenase tetramerica di ''Haloarcula marismortui'' sono stati studiati. L'eccesso segnato di residui acidi in questa enzima alofila crea un obiettivo ideale per determinare come specifici danni a residui acidi sono riferiti al vicinato strutturale e chimico loro. Quattro conclusioni sono disegnate. (i) i residui acidi che interagiscono con le catene laterali di residui lysine e arginine sono colpiti meno dai danni causati dalla radiazione che quelli che interagiscono con catene laterali di serine, threonine e tyrosine. Questo suggerisce che residui con valori di pK(a) più alti sono più vulnerabili al danno che quelli con un pK(a) più basso. Comunque, tale correlazione non si trovò quando valori di pK(a) calcolati furono ispezionati. (ii) le catene laterale acide localizzate nel sito enzimaticamente attivo sono le più sensibili alla radiazione. (iii) residui acidi nella cavità interna formata dai quattro monomeri e quelli coinvolseri nelli contatti che formano il cristallo sembrano essere particolarmente suscettibili. (iv) Nessuna correlazione fu trovata tra la suscettibilità alla radiazione e l'accessibilità al solvente. Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine. ==A proposito di questa Struttura== 2J5K è una struttura a 4 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Haloarcula_marismortui Haloarcula marismortui]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2J5K OCA]. ==Riferimento== <ref group="xtra">PMID:17211074</ref><references group="xtra"/> [[Category: Haloarcula marismortui]] [[Category: Malate dehydrogenase]] [[Category: Amara, P.]] [[Category: Fioravanti, E.]] [[Category: Madern, D.]] [[Category: Vellieux, F M.D.]] [[Category: Weik, M.]] [[Category: Halophile]] [[Category: Malate dehydrogenase]] [[Category: Nad]] [[Category: Oxidoreductase]] [[Category: Radiation damage]] [[Category: Tricarboxylic acid cycle]] ''Page seeded by [http://oca.weizmann.ac.il/oca OCA ] on Wed Feb 18 00:31:16 2009''

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