Sandbox-insulin-ben

From Proteopedia

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
(מבנה ראשוני של חלבון)
Line 5: Line 5:
===מבנה ראשוני של חלבון===
===מבנה ראשוני של חלבון===
-
חומצות אמיניות מתחברות זו לזו בתגובה כימית שקרויה תגובת דחיסה. בתגובת דחיסה מגיבים הקצה ה- קרבוקסילי של חומצה אמינית אחת עם הקצה ה- אמיני של חומצה אמינית אחרת. בתהליך הבא מוצגים רק קצוות אלה:
+
{{Main|Protein primary structure|Nucleic acid primary structure}}
-
+
-
כפי שאתם רואים הקצה ה- אמיני 'תורם' H, הקצה ה- קרבוקסילי 'תורם' OH ושני אלה מתחברים למולקולת מים H2O שנפלטת.
+
-
בין החנקן של הקצה ה- האמיני של חומצה אמינית אחת ובין הפחמן של הקצה ה- הקרבוקסילי של חומצה אמינית אחרת נוצר קשר חדש – קשר קוולנטי.
+
In [[biochemistry]], the '''primary structure''' of a biological molecule is the exact specification of its atomic composition and the chemical bonds connecting those atoms (including [[stereochemistry]]). For a typical unbranched, un-crosslinked [[biopolymer]] (such as a [[molecule]] of [[DNA]], [[RNA]], or typical intracellular [[protein]]), the primary structure is equivalent to specifying the sequence of its [[monomer]]ic subunits, e.g., the [[nucleotide sequence|nucleotide]] or [[peptide sequence]].
-
הצרוף -CONH- קרוי קשר אמידי או קשר פפטידי.
+
-
1. נתון פפטיד בעל הרצף YRDGEAHYCKCDYW
+
Primary structure is sometimes mistakenly termed ''primary sequence'', but there is no such term, as well as no parallel concept of secondary or tertiary sequence. By convention, the primary structure of a protein is reported starting from the amino-terminal (N) end to the carboxyl-terminal (C) end, while the primary structure of DNA or RNA molecule is reported from the 5' end to the 3' end.
-
הפפטיד עבר הידרוליזה בקצה הקרבוקסילי של טירוזין.
+
The primary structure of a nucleic acid molecule refers to the exact sequence of nucleotides that comprise the whole molecule. Frequently, the primary structure encodes [[Sequence motif|motifs]] that are of functional importance. Some examples of sequence motifs are: the C/D<!--
-
א. כמה תוצרים התקבלו לאחר ההדרוליזה?
+
--><ref>{{cite journal | last = Samarsky | first = DA |author2=Fournier MJ|author3=Singer RH|author4=Bertrand E | year = 1998 | title = The snoRNA box C/D motif directs nucleolar targeting and also couples snoRNA synthesis and localization | journal = EMBO | volume = 17 | pages = 3747–3757 | pmid = 9649444 | doi = 10.1093/emboj/17.13.3747 | issue = 13 | pmc = 1170710 }}</ref>
-
ב. מהי מסתם ( בדיוק של 2 gr/mol )?
+
and H/ACA boxes<!--
-
ג. חשבו את המטען של כל פפטיד ב-pH פיסיולוגי, ב-,pH=4 וב-pH=10.
+
--><ref>{{cite doi|10.1101/gad.11.7.941}}</ref>
-
ד. על סמך איזו תכונה ניתן לבצע הפרדה יעילה בין הפפטידים שהתקבלו בהדרוליזה: הידרופוביות, מטען, מסה? יותר מאפשרות אחת אפשרית אך לא בהכרח.
+
of [[snoRNA]]s, [[LSm|Sm binding site]] found in spliceosomal RNAs such as [[U1 spliceosomal RNA|U1]], [[U2 spliceosomal RNA|U2]], [[U4 spliceosomal RNA|U4]], [[U5 spliceosomal RNA|U5]], [[U6 spliceosomal RNA|U6]], [[U12 minor spliceosomal RNA|U12]] and [[Small nucleolar RNA U3|U3]], the [[Shine-Dalgarno sequence]],<!--
-
 
+
--><ref>{{cite journal |author=Shine J, Dalgarno L |title=Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes |journal=Nature |volume=254 |issue=5495 |pages=34–8 |year=1975 |pmid=803646 |doi=10.1038/254034a0|bibcode = 1975Natur.254...34S }}</ref>
-
האם התשובות יישתנו לכל אחד מהסעיפים אם תנאי התמיסה בה מצויים הפפטידים יהיו מחמצנים ולא מחזרים?
+
the [[Kozak consensus sequence]]<!--
 +
--><ref name="Kozak1987">{{cite journal |author=Kozak M |title=An analysis of 5'-noncoding sequences from 699 vertebrate messenger RNAs |journal=Nucleic Acids Res. |volume=15 |issue=20 |pages=8125–8148 |date=October 1987 |pmid=3313277 |pmc=306349 |doi= 10.1093/nar/15.20.8125|url=http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=3313277}}</ref>
 +
and the [[RNA polymerase III|RNA polymerase III terminator]]<!--
 +
-->.<ref name="pmid6263489">{{cite journal |author=Bogenhagen DF, Brown DD |title=Nucleotide sequences in Xenopus 5S DNA required for transcription termination |journal=Cell |volume=24 |issue=1 |pages=261–70 |year=1981 |pmid=6263489 |doi=10.1016/0092-8674(81)90522-5}}</ref>
===מבנה שניוני של חלבון===
===מבנה שניוני של חלבון===

Revision as of 08:29, 11 June 2015

קורס חלבונים מבנה וקישור תכנית רוטשילד ויצמן

מרצה:שירלי דאובהImage:SHIRLEY_DAUBE.jpg

Contents

מבנה הקורס

מבנה ראשוני של חלבון

Template:Main

In biochemistry, the primary structure of a biological molecule is the exact specification of its atomic composition and the chemical bonds connecting those atoms (including stereochemistry). For a typical unbranched, un-crosslinked biopolymer (such as a molecule of DNA, RNA, or typical intracellular protein), the primary structure is equivalent to specifying the sequence of its monomeric subunits, e.g., the nucleotide or peptide sequence.

Primary structure is sometimes mistakenly termed primary sequence, but there is no such term, as well as no parallel concept of secondary or tertiary sequence. By convention, the primary structure of a protein is reported starting from the amino-terminal (N) end to the carboxyl-terminal (C) end, while the primary structure of DNA or RNA molecule is reported from the 5' end to the 3' end.

The primary structure of a nucleic acid molecule refers to the exact sequence of nucleotides that comprise the whole molecule. Frequently, the primary structure encodes motifs that are of functional importance. Some examples of sequence motifs are: the C/D[1] and H/ACA boxes[2] of snoRNAs, Sm binding site found in spliceosomal RNAs such as U1, U2, U4, U5, U6, U12 and U3, the Shine-Dalgarno sequence,[3] the Kozak consensus sequence[4] and the RNA polymerase III terminator.[5]

מבנה שניוני של חלבון

מבנה שלישוני של חלבון

חלק 1

חלק 2

חלק3

מבנה רביעוני

קואופרטיביות ואלוסטריה והסיפור של המוגלובין

קביעת מבנה - שיטות לאנליזה של חלבונים

סיפור האינסולין

Human insulin chain A (grey) and chain B (green), 3i40

Drag the structure with the mouse to rotate
For additional details see Insulin Structure & Function.


3D structures of Insulin (Updated on 11-June-2015)

{{#tree:id=OrganizedByTopic|openlevels=0|

יציבות וקיפול של חלבונים במבחנה

קיפול חלבונים בתא

Personal tools